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主要组织相容性复合物(MHC)是一群紧密连锁高度多态的基因,编码主要组织相容性抗原,在脊椎动物机体的免疫系统中具有重要作用,因此MHC常作为家畜抗病育种的候选基因。本研究采用PCR-SSCP、PCR-RFLP技术对莱芜黑山羊、波尔山羊、鲁波杂交山羊3个山羊种群共175只个体的DQA1、DQA2、DQB1基因外显子2进行了遗传多态性分析,并对DQB1、DQA2基因多态性与线虫抗性、免疫性状的相关性进行了研究,其结果如下:1.采用PCR-SSCP技术对DQA1基因外显子2多态性进行了分析,共检测到8种基因型,并对其纯合子进行了测序,检测到23处碱基突变。2.对人类、山羊、绵羊、牛DQA1基因外显子2核苷酸序列进行同源性比较,结果发现同源性很高。3.采用PCR-RFLP技术对莱芜黑山羊、鲁波杂交山羊和波尔山羊DQA2、DQB1基因外显子2进行多态性分析,共检测到4种DQA2基因外显子2基因型,7种DQB1基因外显子2基因型。通过酶切图谱和测序分析表明,DQA2基因外显子2的第77、79、80和169位的碱基表现出多态性,DQB1基因外显子2的第24、151位的碱基表现出多态性。4.应用SAS 8.0软件GLM程序对DQA2、DQB1基因不同基因型与线虫抗性进行了相关分析,在DQA2基因中,基因型与线虫EPG有一定的相关性,但没有达到显著水平(P>0.05)。在DQB1基因中,BC、DD基因型的线虫EPG显著低于BB基因型(P<0.05),在种群内的分析中发现,鲁波杂交山羊中,BC基因型的线虫EPG显著低于AC基因型(P<0.05)。其它基因型与线虫EPG也有一定的相关性,但没有达到显著水平(P>0.05)。5.应用SAS 8.0软件GLM程序对DQA2、DQB1基因不同基因型与免疫性状进行了相关分析,在DQA2基因中,莱芜黑山羊中AB基因型的RBC低于BB、BC基因型(P>0.05),而MCH高于BB、BC基因型,但没有达到显著水平(P>0.05);BC基因型的W-LCR高于AB、BB基因型(P>0.05),而W-SCC低于AB、BB基因型,但没有达到显著水平(P>0.05)。鲁波杂交山羊中AB基因型的RBC显著高于BB基因型(P<0.05),高于BC基因型(P>0.05);AB基因型的WBC显著高于BC基因型(P<0.05),高于BB基因型(P>0.05);AB基因型的HCT显著高于BB、BC基因型(P<0.05);BC基因型的W-LCR显著高于BB基因型(P<0.05),高于AB基因型(P>0.05)。在DQB1基因中,莱芜黑山羊中BC基因型的W-SCR显著高于AC、CC基因型(P<0.05),W-LCR显著低于CC基因型(P<0.05),W-LCC低于AC、CC基因型,但差异不显著(P>0.05);波尔山羊中BC基因型的W-LCC低于AA、AB基因型,但差异不显著(P>0.05);鲁波杂交山羊中BC、AC基因型的W-LCC显著低于AA基因型(P<0.05)。