毛果杨赤霉素合成相关的ODD基因家族分子进化和功能分析

来源 :北京林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yy19880904
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2-酮戊二酸依赖性双加氧酶(2-oxoglutarate dependent dioxygenase,2-ODD/ODD)是一类重要的氧化酶,参与动物、植物和微生物体内的多种氧化反应。本研究以木本模式植物毛果杨(Populus trichocarpa)为研究材料,旨在探究不同的ODD基因家族成员在赤霉素的合成和代谢途径中的功能,并进一步探讨其功能分化机制。通过对毛果杨中与赤霉素合成相关的ODD基因家族成员的基因结构、表达模式、亚细胞定位等进行分析,得出以下主要结论:  1)在毛果杨中共鉴定出124个ODD基因,其中有27个参与赤霉素的生物合成途径。与双子叶模式植物拟南芥相比,毛果杨ODD基因家族发生了基因扩张。  2)将毛果杨的27个PtODD基因分为4个亚家族:C19-GA2ox、C20-GA2ox、GA3ox、GA20ox。这27个PtODD基因定位在毛果杨基因组19条染色体中的14条上,其中有10对基因位于成对的同源区域内,具有很好的共线性关系,所占比例为74.07%,可能形成于基因组的大片段重复事件;6个基因形成3个基因簇,所占比例为22.22%,可能来源于基因的串联重复。推测大片段重复是毛果杨中参与赤霉素合成代谢的ODD基因扩张的主要原因。  3)基因结构分析发现,ODD基因家族不同亚家族之间、同一个亚家族内部的基因具有不同的基因结构,例如亚家族C19-GA2ox成员具有三个外显子而亚家族C20-GA2ox成员具有两个外显子;GA3ox亚家族有些成员有3个外显子,有些只有两个外显子。基因结构的分化可能预示着基因功能的改变。  4)通过基因克隆分离出18个PtODD基因,并构建表达载体进行原核表达,结果显示PtODD基因可以在大肠杆菌中表达。毛果杨18个PtODD蛋白的亚细胞定位没有明显的分化。  本文对毛果杨中参与赤霉素合成与代谢的27个ODD基因家族成员的分子进化和功能分化机制进行了深入研究,结果发现它们的基因结构发生了明显的分化,而功能分化机制并未得到确切解析。
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