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目的:分析自身免疫性脑炎（autoimmune encephalitis,AE）的影像学特征,提高对该病的认识。并探讨基于Freesurfer技术在稳定期抗N-甲基-D天门冬氨酸受体（N-methyl-D-aspartate receptor,NMDAR）脑炎患者灰质形态中的应用价值,进一步研究皮层厚度、体积及深部灰质体积的改变与改良Rankin量表（modified Rankin scale,mRS）、认知量表评分的相关性。方法:收集2012年10月至2018年10月于重庆医科大学附属第一医院神经内科确诊的108例AE患者,并分成NMDA组（66例）和非NMDA组（42例）。所有患者在入院后1周内均行头颅MRI平扫和增强检查,48例稳定期抗NMDAR脑炎患者在出院46个月内接受脑MRI复查,观察病灶的信号、分布情况以及强化方式。并收集40名年龄、性别、受教育程度相匹配的健康对照组（healthy control,HC）,对所有受试者进行常规MRI及全脑的高分辨率3D-T1WI结构扫描,利用Freesurfer软件分析两组间皮层厚度、体积及深部灰质体积的差异,与患者的mRS评分及认知量表评分进行相关性分析。结果:（1）（1）4例卵巢畸胎瘤和1例纵隔畸胎瘤均发生在抗NMDAR脑炎患者,3例小细胞肺癌均发生在抗GABABR抗体相关脑炎患者。（2）位列前三的临床症状依次为精神行为异常、癫痫及不自主运动,发热和不自主运动NMDA组高于非NMDA组,语言障碍、癫痫发作及意识障碍NMDA组低于非NMDA组。（3）首次MRI检查时,34例患者常规MRI平扫多个脑区均可见病变,NMDA组以非边缘叶为主而非NMDA组以边缘叶为主;绝大部分病灶在T1WI为等、稍低或低信号,T2WI和FLAIR为稍高信号或高信号;增强后10例患者表现脑膜强化、病灶区血管内增粗及病灶内斑片状强化。○4 48例抗NMDAR脑炎患者复查MRI,5例病灶消失,1例出现了新的病灶,11例年轻患者表现为脑萎缩。（2）（1）控制年龄、受教育程度及病程后,与HC组相比,患者在左侧颞中回、左侧颞上回及左侧梭状回皮层厚度明显减低（CWP<0.05）;右侧枕叶外侧皮质体积明显减少（CWP<0.05）;双侧海马和右侧丘脑的深部灰质体积明显减少（CWP<0.05）。（2）患者在右颞叶皮质（颞上回、颞中回、梭状回）皮层厚度与MMSE评分呈正相关（r=0.507,r=0.572,r=0.602,P均<0.05）;左侧颞中回与AVLT-DR分数显著相关（r=-0.533,P<0.05）;左侧梭状回皮层厚度与SDMT分数呈正相关;双侧海马体积与MMSE分数显著相关（r=0.542,r=0.445,P<0.05）;患者皮层体积与认知分数之间,无显著相关性（P>0.05）。（3）患者皮层厚度、皮层体积、深部灰质体积与疾病严重程度（mRS分数）之间,均无显著相关性。结论:（1）抗NMDAR脑炎可累及以皮层为主的多个脑区,其余亚型AE累及以海马为主的边缘系统。（2）FLAIR序列是观察该病的重要序列,DWI可发现常规MRI不能发现的隐匿性病变。（3）抗NMDAR脑炎患者多个脑区皮层厚度变薄、体积减少、深部灰质体积下降,且认知功能受损,部分脑区皮层厚度及深部灰质体积的改变与抗NMDAR脑炎患者认知功能障碍相关。