南海北部海区具有复杂的生态环境特征，既有珠江冲淡水和沿岸上升流，又有寡营养的开阔海区，海区物理过程（冲淡水、上升流、黑潮等）多变。浮游动物通过摄食和被摄食调控初级生产力和影响上层食物链及其它动物资源产量，其种群动态变化直接影响着生态系统的物质和能量循环。同时浮游动物又是海洋环境气候变化的良好指示者。论文通过对南海北部2007-2011年不同区域的浮游动物7个航次调查采样，分析了夏季南海北部浮游动物的种类组成及分布、丰度和生物量的时空变化、优势种演替、浮游动物群落结构，研究浮游动物的中长期变化，探讨其变化的影响机制，以期对南海北部生态系统的今后深入研究提供基础资料，为南海北部海洋生物资源的可持续利用提供科学依据。　　 南海北部浮游动物的生态类型以广温广盐类型和热带暖水类型为主，其表现为热带、亚热带区系。2007年夏季南海北部浮游动物调查，共鉴定终生浮游动物258种和阶段性浮游幼虫17个类群，其中桡足类出现的种类最多，为118种;其次是水母类，为43种。浮游动物优势种主要有海胆长腕幼虫(Echinopluteuslarvae)、肥胖箭虫（Flaccisagittaenflata）、亚强次真哲水蚤（Subucalanussubcrassus）、裂劾蛮虫戎（Lestrigonusschizogeneios）、异尾宽水蚤（Temoradiscaudata）、长尾类幼体（Macruranlarvae）、小哲水蚤(Nannocalanusminor)、锥形宽水蚤（Temoraturbinata）和正型莹虾（Lucifertypus）。浮游动物平均丰度为133.43±93.32ind.m-3，平均生物量为328.431±305.23mgm-3，其都表现为近岸高于远海，高值区主要出现在珠江口外围和粤东上升流海域。聚类分析将南海北部浮游动物分成两个自然群落，即近岸群落和远岸群落，反映了南海北部浮游动物群落从近岸到远海的演替。　　 通过比较南海北部珠江冲淡水和粤东上升流区域、吕宋海峡西部受黑潮水影响区域、南海北部深海海盆区三个不同海域浮游动物的种类组成和群落结构特征，发现浮游动物种类组成和群落结构呈明显的区域变化。(1)在南海西北部海域共鉴定出终生浮游动物163种和阶段性浮游幼虫17个类群，桡足类是最主要的类群。南海西北部海区浮游动物优势种依次为尖额谐猛水蚤（Euterpinaacutifrons），强额孔雀水蚤（Pavocalanuscrassirostris），锥形宽水蚤（Temoraturbinata），多毛类幼虫（Polychaetalarvae），肥胖箭虫（Flaccisagittaenflata），小纺锤水蚤(Acartianegligens)，长尾住囊虫（Oikopleuralongicauda），小三角水蚤（Triconiaminuta），矮拟哲水蚤（Paracalanusnanua）。南海西北部海域浮游动物平均丰度为284.92±278.33ind.m-3，高值区主要集中在上升流最强的汕头外海附近海域。聚类分析结果表明，粤东海域浮游动物分为三个类群，受上升流影响的浮游动物类群，受上升流和冲淡水共同影响的浮游动物类群和外海类群。在S305站进行了浮游动物的分层昼夜垂直移动的调查，结果表明浮游动物有明显的昼夜垂直移动。(2)而在吕宋海峡，浮游动物共鉴定出浮游动物257种和浮游幼虫12个类群，吕宋海峡西部海域浮游动物种类数和多样性比中东部海域的高。吕宋海峡附近海域浮游动物平均丰度为16.76±11.36ind.m-3。其中，吕宋海峡西部海域浮游动物平均丰度高于吕宋海峡中东部海域。聚类分析结果表明，吕宋海峡浮游动物可分为两个类群，一类为分布于吕宋海峡的中东部，受黑潮水影响的类群，另一类为分布于吕宋海峡西部，受南海水影响的类群。吕宋海峡浮游动物群落结构反映了该海域浮游动物的种类组成和分布受不同性质水团的调控。(3)在南海北部深海区（18°N断面）共鉴定出南海深海区的浮游动物为136种和浮游幼虫7个类群，其中桡足类种类最多，为70种、其次为水母类15种和被囊类10种，其余类型浮游动物均少于10种。夏季南海深海区浮游动物优势种依次为彩额锚哲水蚤（Rhincalanusrostrifrons）、肥胖箭虫(Flaccsagittaenflata)、狭额次真哲水蚤（Subeucalanussubtenuis）、长角海羽水蚤（Haloptiluslongicornis）、达氏筛哲水蚤（Cosmocalanusdarwinii）、双尾萨利纽鳃樽（Thaliademocratica）、细拟真哲水蚤（Pareucalanusattenuatus）和正型莹虾（Lucifertypus）。夏季南海中部海域浮游动物丰度变化范围为7.5-14.7ind.m-3，平均为11.27±2.14ind.m-3。南海北部深海海盆区主要受高温高盐外海水的影响，其浮游动物优势种主要是高温高盐的类型。其次，南海北部深海海盆区属于寡营养盐水域，因此大型网采浮游动物的丰度较近岸低。但是南海北部深海海盆区浮游动物多样性指数却高于南海北部近岸海域。　　 总体来说，2007-2011年南海北部整个区域浮游动物，与历史研究对比发现，2007-2011年夏季南海北部浮游动物丰度有下降趋势，其与叶绿素a的变化趋势相同。这可能与2007-2011年南海北部气候变化有很大关系。一般来讲，在厄尔尼诺年份南海北部近岸浮游动物丰度升高，而在拉尼娜年份则相反。浮游动物优势类群也有较大变化。桡足类丰度下降程度最剧烈，其次为浮游幼虫。　　 受2008年初冷异常事件的影响，2008年夏季南海北部浮游动物种类组成和群落结构发生了较大变异。与2007年夏季相比较，2008年南海北部海域浮游动物丰度有很大下降。2007年夏季浮游动物丰度为133.37ind.m-3，其在2008年夏季下降为75.49ind.m-3。桡足类丰度下降，水母类和海樽类的丰度上升。同时浮游动物群落结构也发生了较大变化，一些暖水桡足类优势种丰度下降，取而代之的是水母类和海樽类。　　 为了解使用不同网具采样对南海北部浮游动物群落特征分析的影响，本研究还采用了网目孔径为505μm（大网）和160μm（中网）的两种网具进行了浮游动物采样。研究结果表明，虽然两种网具对个体较大的浮游动物（水母类、磷虾类和毛颚类等）的捕获率差别不显著，但是大型网捕获的个体较大的浮游动物种类数较中型网捕获的多;对于个体较小的浮游动物，尤其是小型桡足类，大型网的捕获效率远远低于中型网，差异显著;其中对于13种主要小型桡足类（锥形宽水蚤Temoraturbinata、瘦拟哲水蚤Paracalanusgracilis和丽隆水蚤Oncaeavenusta等）种群，其在中网的丰度之和为大网之和的11倍之多。由此可见，两种网具是可以互补的。聚类分析结果表明，尽管两种网具所捕获的浮游动物种类组成不同，但浮游动物的群落结构相似，即无论大型网或是中型网采集的浮游动物，都能被分为近岸和远岸两个类群。