【摘 要】
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该文运用量子化学计算方法,结合生物信息学手段评价了prion的自由基假说,并提出了自己的观点.对于小分子C-H BDE的计算,我们采用B3LYP/6-31G全优化分子结构的方法;对于大分子C-
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该文运用量子化学计算方法,结合生物信息学手段评价了prion的自由基假说,并提出了自己的观点.对于小分子C-H BDE的计算,我们采用B3LYP/6-31G<**>全优化分子结构的方法;对于大分子C-H BDE的计算,我们采用AM1优化结构结合B3LYP/6-31G<**>计算单点能的方法,该方法的可行性基于AM1优化结构准确且节约时间.C-H BDE是C-H键强弱的量度,它的大小反映了键断裂形成自由基的难易程度,为了研究侧链和局域环境对C-HBDE的影响,我们通过量子化学计算探讨了影响BDE的因素.发现:取代基的性质、二面角φ和ψ的值、温度等因素都会影响C-H BDE的大小.在多肽链的二级结构中,二面角Φ和Ψ是影响C-HBDE的主要因素,每一对(Φ,Ψ)对应一个BDE值,BDE的数值随Φ与Ψ的变化而变化.因此,在蛋白质的多肽链中,二级结构不同是导致受损伤与否的主要原因,这对于判断蛋白质自由基的形成位点提供了理论依据.总之,该文借助理论方法评价了prion的自由基假说,并提出了自己的观点,这对于解释疯牛病的散发性有重要启示性意义.
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