【摘 要】
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屠体性状是鸡加工生产中的重要经济性状,通过在鸡基因组中寻找影响屠体性状的候选基因,连锁不平衡标记(linkage disequilibrium marker)和直接标记(directmarker),利用标记辅
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屠体性状是鸡加工生产中的重要经济性状,通过在鸡基因组中寻找影响屠体性状的候选基因,连锁不平衡标记(linkage disequilibrium marker)和直接标记(directmarker),利用标记辅助选择可以比较快速地对鸡进行遗传选择,从而能够加快对屠体性状的遗传育种进展。为了获得影响屠体性状的候选基因和连锁不平衡标记,本研究对鸡27号染色体(GGA27)进行了精细定位,希望找到影响屠体性状的候选基因,结果如下:利用3个多态性丰富的微卫星与2个高密度单核苷酸多态性标记(singlenucleotide polymorphism,SNP)对GGA27利用CRI-MAP2.4程序进行遗传图谱构建,成功构建了比较完整的长度为103.6 cM遗传图谱。利用QTL在线分析软件QTLExpress对该染色体上屠体性状进行了QTL扫描定位。翅膀重QTL被定位到GGA27上的99 cM处(F=5.22,P<0.05),该QTL解释翅膀重表型变异的0.4%,与其他研究者在该染色体上的结果重复,可以用于下一步精细定位。腿肉重QTL被首次定位到GGA27上的102 cM处(F=4.89,P<0.05),该QTL解释腿肉重表型变异0.8%。皮脂厚QTL被首次定位到GGA27上的103 cM处(F=5.03,P<0.05),该QTL解释皮脂厚表型变异的3%。对显著性定位到的屠体性状QTL中,挑选解释变异比较大的皮脂厚QTL和在本研究中被重复定位到的翅膀重QTL进行进一步精细定位。在标记MCW0328到M2之间(间隔大约1.45 Mb)加大标记密度,选择24个SNP利用Haploview v 4.0软件进行连锁不平衡分析获得连锁不平衡的有效跨度。GGA27末端标记MCW0328与M2之间的平均连锁不平衡有效跨度为85179 bp。在MCW0328到M2之间,选择平均间隔85179 bp的32个SNP密度对翅膀重和皮脂厚性状进行关联分析。其中S2,S4和L6位点显著性的影响翅膀重(P<0.05),S5位点极显著的影响翅膀重。S2位点落在Hoxb-13基因和MicroRNA196-1基因之间,S5位点落在嘌呤霉素敏感氨基肽酶基因上。这3个基因通过NCBI查询文献和生物学意义分析发现最有可能是影响翅膀重的候选基因。S6,S7,S8和L16位点显著性影响皮脂肪厚性状,通过NCBI查询文献以及生物学意义的分析,发现S7位点的过氧化物酶体增生物激活受体结合蛋白基因最有可能是影响皮脂肪厚性状的重要候选基因。
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