利用AFLP、SSR、CAPS标记构建茄子的分子遗传图谱

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茄子(Solanum melongena L.)是重要的蔬菜作物种类之一,我国是世界茄子栽培面积最大的国家。随着植物基因组学的发展,许多作物已经由传统育种进入分子育种阶段,但茄子分子育种还处于起步阶段。   分子遗传图谱的构建是植物分子育种的基础,目前茄子图谱中的标记数量还不是很多,需要迸一步增加。   本研究以武汉市农科院航天茄子‘变色龙’自交4代后的自交系05-3-6-14-3为母本、湖南地方品种‘湖南小圆茄’为父本构建F2群体,用F2群体的88个单株,采用AFLP、SSR、CAPS三种分子标记技术构建了茄子的分子遗传连锁图谱。主要研究结果如下:   1.对双亲用225对AFLP引物组合进行筛选,有67对扩增稳定、带型清晰、综合效果好,共获得128个多态性标记。每个引物组合扩增的多态性标记位点数量的变异幅度在1~5之间,平均每对引物组合产生个1.8个多态性位点。在128个标记位点中,116个标记为显性标记,带型表现为有带、无带;其中59个显性标记来自父本,占总数的50.9%,57个显性标记来自母本,占总数的49.1%。12个分子标记表现出共显性特征。   2.从已发表的茄子SSR遗传图谱上均匀挑选211个标记,筛选出了39个标记在两个亲本间有多态,多态比例为18.5%。其中,4个标记为显性标记,占总数的10.3%,其他为典型的共显性标记。   3.从茄科基因组网站(http://solgenomics.net)选择181对番茄序列特异引物对茄子父母本进行扩增,有72对扩增出清晰条带,比率为39.8%,其中有5对得到直接多态性,另外有5对经限制性内切酶酶切产生多态性。   4.利用JionMap3.0软件构建了一张茄子的遗传图谱,其中包括123个AFLP标记,40个SSR分子标记和1个COS标记。有19个连锁群,覆盖茄子染色体组633.3cM。连锁群的长度从6.9cM到104.1cM,每个连锁群的标记数目介于2和53之间,标记间平均图距为3.86cM。平均间距最大的连锁群是LG10,为15.55cM,平均间距最小的连锁群是LGI(1),为1.96cM。
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