电子政务网络系统的安全问题，是伴随着政府机关推进一网式综合管理、无纸化办公而产生的。其中G2B模式系统下的招标与税务管理典型模块的核心数据库中敏感信息的泄露，G2E模式系统下的公文管理典型模块的内部数据库的非法入侵，是最重要的两个问题。针对第一个问题，本文研究和应用了加密技术去解决。对加密技术本文从数据的加密算法与数据库结构的加密方法两方面进行了研究。对于数据加密算法：研究了MD5算法；设计实验比较ECC与RSA算法的加密耗时，在此基础上研究了AES与ECC的混合加密算法；研究了MOES算法，设计实验比较OPES与MOES算法明文密文间的拉伸范围和MOES输出与明文分布的贴合度。根据研究和比较结果提出了针对税务管理模块数据库加密的具体应用方案。对于数据库结构加密，研究了结构加密的原理、原则，加密模型，针对招标管理模块的数据库设计了表的语义映射、表的分解关系与合成关系，并提出了将混合算法与结构加密复合应用的方案。针对第二个问题，本文应用基于数据挖掘的数据库入侵检测技术去解决。研究了Apriori算法与FP-Growth算法。针对公文管理模块，利用Trace设计了审计数据的采集方案并分别采用Apriori与FP-Growth算法，详细设计了频繁项集的产生过程并提出了入侵检测系统的具体应用方案。最后本文构建了模拟的电子政务系统，将应用方案在系统平台实现，从应用结果看出，本文设计的加密方案是可行的有效的，达到了加密的效果；入侵检测方案也是有效的，其中基于FP-Growth算法的入侵检测系统的效果更好。