锯缘青蟹双顺反子病毒全基因组测序及呼肠孤病毒检测方法研究

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锯缘青蟹Scylla serrata是我国重要的海水养殖品种,在东南沿海地区养殖广泛,但是疾病的发生造成了很大的经济损失,严重影响着本行业的健康发展。本文对在患“嗜睡病”的锯缘青蟹发现的两种病毒锯缘青蟹双顺反子病毒(Mud crab dicistrivirus,MCDV)和呼肠孤病毒(mud crab reovirus,MCRV)在进行分离纯化的基础上,确定了两种病毒的致病性,对MCDV的全基因组测序并进行系统进化分析,另外,还建立了MCDV和MCRV的检测方法。 通过CsCl平衡密度梯度离心,从患病锯缘青蟹鳃组织分离到了两种大小不同的病毒、人工感染实验表明这两种病毒对锯缘青蟹都有致病性。其中,个体较小的病毒直径为20-30nm,球形,无囊膜,呈二十面体对称,在CsCl.中的浮力密度为1.32-1.36g/cm3。核酸性质分析发现此病毒基因组为ssRNA,有部分双链结构,在0.8%的琼脂糖上的分子量约为10.7kb,SDS-PAGE凝胶电泳发现核衣壳由分子量分别为22、35和53kD的三种蛋白组成。全基因组测序与分析发现该病毒的基因组包含两个大的开放读码框(ORF),5ORF编码的蛋白包括解旋酶、蛋白酶和RNA聚合酶在内的三个非结构蛋白的功能结构域;3ORF编码结构蛋白。两个ORF被基因间非编码区(IGR)隔开,在整个基因组的两端还各有一个非编码区:5-UTR和3-UTR。该病毒具有双顺反子病毒科的典型特征,命名为锯缘青蟹双顺反子病毒(MCDV)。根据MCDV非结构蛋白和结构蛋白氨基酸多序列比较构建的系统树发现MCDV可能是与TSV的亲缘关系最近的、双顺反子病毒科的一个新种。另外,还建立了本病毒的特异性套式RT-PCR检测技术,灵敏度可达0.001pg。组织病理学研究发现,感染MCDV的青蟹个体,鳃丝细胞上皮肿大、变性、部分脱落,鳃腔内有血淋巴细胞浸润;心肌纤维排列紊乱、断裂、轻度水肿和变性,心肌灶性坏死,周围有大量血淋巴细胞浸润;肝小叶间有血淋巴细胞浸润,且出现嗜伊红的小体,肝胰脏细胞变性、坏死、排列轻度紊乱;肌纤维紊乱、断裂、坏死,肌纤维间有少量血淋巴细胞浸润;神经组织变性,灶性坏死(FN),有大量血淋巴细胞浸润(H),嗜伊红的小体(AB)出现。电子显微镜观察发现在感染MCDV的锯缘青蟹的鳃、心脏、肌肉、神经等组织中有大量直径为20-30nm的病毒颗粒,这些病毒有的形成包函体,有的散落存在。 个体较大的病毒直径为50-60nm,球形,无囊膜,表面光滑,无棘突,呈二十面体对称,在CsCl中的浮力密度为1.42-1.44g/cm3。基因组由13个dsRNh节段组成,PAGE电泳带型特点为1/5/7,分子量分别为4.69kb、2.85kb(×2)、2.53kb(×2)、2.29kb、1.57kb、1.35kb、1.29kb(×3)、1.19kb(×2),属于呼肠孤病毒科的一个新属,命名为锯缘青蟹呼肠孤病毒(MCRV);本文还通过RT-PCR技术,克隆了MCRV的部分核酸片段,并测定了核酸序列,以此序列为基础,设计了两对锯缘青蟹呼肠孤病毒的特异性引物,建立了MCRV的套式RT-PCR检测技术,灵敏度可达0.001pg。
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