2013年全国开展商事改革，《公司法》也进行了大规模修改，商事登记制度是这次全面改革成效显著的领域。在立法思想上，商事登记制度摒弃了计划经济时代商事登记制度为国家管理市场而设立的初衷，更多的融入服务精神，鼓励市场经济和商主体的自由发展。本文从商事登记制度的基本理论分析入手，比较国内外不同国家对商事登记定义、效力、法律性质、作用、发展历史、价值取向的异同，并对比各国立法、审查和机构设置模式，找出我国商事登记制度现存的问题并加以分析。一方面，从法律设立初衷分析，该制度是为政府管理之便，故在价值取向的选取上侧重安全价值。市场发展高速发展下，其应减弱行政属性，更好服务于商主体。政府应率先转变行政思路，从“全能政府”转向“有限服务型政府”，简化登记程序。另一方面，从我国现有商事登记法律分析，商事登记立法分散、内容的庞杂、法律间有冲突和空白，也使商事登记的适用出现问题。在现实迫切的需要下，商事登记的改革从深圳、广州、上海等实验区迅速开展推广至全国。改革带来的主要变化有，注册资本“实缴制”到“认缴制”、商事主体资格与营业资格分离、商事登记的信用机制完善，“年检制度”到“年报制度”。目前，改革初步取得成功但仍有不足，如法律适用的冲突，以及信用体系的滞后性。最后，笔者提出立法建议，商事登记制度需建立统一的立法、在法律中明确商事登记与营业执照的关系和完善商事登记公示的对抗力和公信力。