目前，科技创新已经成为引领经济社会发展的主要力量。科技创新能力的不断提升给人类文明带来前所未有的繁华，人们在享受着科技带来福祉的同时也遭遇着日益严重的生态问题。于是人们开始顿悟，保护环境、爱护地球已经是刻不容缓的事情。就这样生态学受人类的重视的程度越来越高，到目前为止已经成为引导人类社会进行可持续性发展的重点学科之一。在我国国家创新体系建设的过程中，城市创新体系不仅是提高整个国家创新能力的关键性力量，还是我国综合国力的强大支柱，因此，在建设创新型城市的战略背景下，加强对合肥创新体系生态化的理论研究显得尤为重要，对于城市创新体系建设的效率提高也具有重要的现实意义。本文对合肥市城市创新体系进行生态化审视是当前社会经济发展的必然选择。在合肥市创新体系生态化研究过程中，本文将生态位理论、系统论、协同演化等理论引入到城市创新建设中是一次崭新的尝试，城市创新体系生态化是一个边缘交叉的研究课题，涉及众多学科领域，因此我们要采用多种学科理论和研究相结合的方法进行综合的研究。它大体包括城市创新主体的个体生态化建设和创新体系的系统生态化建设两个主线内容。通对城市创新生态化的研究，指出合肥市存在的问题的同时也针对性的提出了具体的生态化策略。本文借此用来帮助合肥市城市创新走上生态的发展道路，对促进“十二五”规划的顺利实施方面具有建设性的意义。