进入二十一世纪，我国高等教育办学规模扩大、在校学生人数大幅增加、办学条件得到明显改善，对教育经费的需求大量增加，而国家财政教育经费有限，高校只能以银行借款来弥补国家教学经费投入的不足，而结果是高校银行借款大量增加，债务利息成为高校的沉重负担，财务风险已经成为国内部分高校发展的障碍。本文以高校财务风险控制理论和财务风险预警理论为指导，考察了高校财务现状及其成因，指出了高校财务风险与企业财务风险的不同之处，并对高校财务风险形成因素进行了分析。根据财务风险评价指标体系应遵循的原则，选取了累计贷款总额占总资产比重、累计借款占总收入比重风险、基建投资财务风险、现金支付能力风险等12个指标来评价了高校财务风险，建立了高校财务风险评价模型，用来衡量并判断财务风险的大小。选取湖南省两所高校对财务风险大小进行了评判，认为应从加强政府的监督管理，控制贷款规模，完善贷款的相关制度等方面着手控制高等学校财务风险。