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目的:通过检测黔北地区NSCL/P患者核心家系和对照组核心家系MTHFR基因C677T及A1298C位点多态性,了解其等位基因及基因型的分布特点,并探讨基因多态性与NSCL/P的相关性。方法:1.收集45例对照组核心家系和60例NSCL/P核心家系的外周静脉血,提取其基因组DNA,并采用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的提取质量;2.根据MTHFR基因C677T及A1298C位点多态性设计上下游引物,采用PCR及二代测序技术对病例组及对照组核心家系样本进行SNPs检测,在线BLAST比对扩增序列,检测是否为研究的目的片段。采用chromas序列读取软件和MEGA7序列分析软件进行基因分型,应用SPSS19.0统计学软件行数据分析,以卡方检验进行Hardy-Weinberg平衡检验,并比较各组间各基因型及等位基因频率的分布特点;3.采用病例父母对照研究对病例组核心家系等位基因进行HHRR分析,杂合子父母及患儿进行TDT检验,并对病例组及对照组父母突变等位基因进行合并分析,进一步探讨病例组及对照组核心家系MTHFR基因C677T及A1298C多态性位点与NSCL/P的相关性。结果:1.本研究对照组及病例组核心家系均未检测出MTHFR基因C677T位点纯合及杂合突变;而A1298C位点则检测出突变;2.以对照组和病例组核心家系MTHFR基因A1298C位点基因型的观察值和期望值进行Hardy-Weinberg平衡检验,对照组和病例组子代、母亲、父亲结果均无统计学差异(P>0.05),其结果显示两核心家系均符合Hardy-Weinberg平衡法则,表明研究样本具有群体代表性;3.对照组与病例组核心家系子代及父亲的A1298C位点基因型及等位基因的频率分布差异均无统计学意义(P>0.05),母亲A1298C位点基因型及等位基因频率分布有统计学差异(P<0.05),其中母亲CC基因型相对于AC和AA基因型的OR值和95%CI分别为OR=0.142(95%CI:0.027~0.745)和OR=0.135(95%CI:0.026~0.687),突变等位基因C相对于等位基因A的OR=0.525(95%CI:0.289~0.953);4.将病例组核心家系双亲的基因型及等位基因进行合并与子代比较,其基因型之间无统计学差异(P>0.05),突变等位基因也无统计学意义(P>0.05);5.在基于HHRR关联法分析中,以病例组核心家系父母传递给患病子女的两个等位基因构成为“病例组”和未传给子女的两个等位基因构成的虚拟“对照组”进行比较分析,结果显示MTHFR基因A1298C多态性与NSCL/P无显著关联性(P>0.05);6.根据病例组父母基因型在患病子女中的传递情况,去除两位点纯合子父母家系,进行TDT检验,结果显示A1298C多态性位点与NSCL/P患者之间未发现存在连锁不平衡(P>0.05);7.将病例组与对照组父母总的突变等位基因进行合并分析,两组父母突变等位基因频率分别为23.75%和34.44%,经检验差异无显著性统计学意义(P>0.05)。结论:1.在本研究观察范围内未检测出病例组及对照组家系MTHFR基因C677T位点纯合及杂合突变;2.MTHFR基因A1298C位点多态性可能不是黔北地区NSCL/P患者的发病因素,且母亲MTHFR基因A1298C位点多态性可能是子代患病的保护因素;3.黔北地区NSCL/P患者MTHFR基因A1298C位点未见遗传失衡现象,MTHFR基因A1298C位点多态性与NSCL/P的发生无关联性。