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为了解广东地区新城疫病毒(Newcastle Disease viruses.NDV)的流行情况，本研究选择了从该地区的鹅、鸭、鸽、野鸟等不同宿主中分离到的共23株NDV进行序列分析，提取上述NDV分离株的RNA，参考GenBank中已发表的NDV F基因序列，设计出用于扩增F基因的引物，应用RT-PCR技术成功地扩增了以上分离株的部分F基因，进行测序，截取F基因47--375 nt段序列，利用Mega4.0软件进行基因分型并绘制系统进化树。
F蛋白裂解位点区(112-117)氨基酸的序列分析结果显示18株NDV分离株属于强毒株，5株NDV分离株属于弱毒株。其中，所有基因Ⅶ型、基因Ⅵ型分离株属于强毒株，所有基因I型分离株属于弱毒株；所有鹅源分离株属于强毒株，4株鸽源分离株中3株属于强毒株，8株野鸟源分离株中5株属于强毒株，5株鸽源分离株中4株属于强毒株。基因分型结果显示23株NDV中，6株鹅源分离株全部属于基因Ⅶ型；5株鸽源分离株中4株属于基因Ⅵ型，1株属于基因I型；8株野鸟源分离株中，3株基因I型，3株属于基因Ⅵ型，2株属于基因Ⅶ型；4株鸭源分离株中3株属于基因Ⅶ型，1株属于基因I型。结果说明基因Ⅶ型是鹅源分离株的优势基因型；基因Ⅵ型是鸽源分离株的优势基因型；野鸟源分离株存在基因I型、基因Ⅵ型、基因Ⅶ型，情况比较复杂；基因Ⅶ型是鸭源分离株的优势基因型。23株NDV中11株属于基因Ⅶ型，7株属于基因Ⅵ型，5株属于基因I型，说明基因ⅦNDV强毒株是广东地区的主要流行株，为了解广东地区的新城疫的流行情况提供了实验数据。
系统进化树分析结果显示在23株NDV野毒株中，Goose/China/60、Goose/China/61、Wildbird/China/73, Duck/China/98、Goose/China/100、Wildbird/China/74与Goose/China/102相似性高达99％，处于同一进化分支；而Wildbird/China/72、Pigeon/China/11、Widlbird/China/80、Pigeon/China/55与Widlbird/China/77相似性较高，处于同一进化分支；Wildbird/China/71、Wildbird/China/75、Wildbird/China/76、Duck/China/52与Pigeon/China/54等毒株处于同一进化分支。野鸟源分离株存在于不同进化分支，并且分别与鸭源、鸽源和鹅源分离株都具有较高的相似性。结果表明飞禽、水禽中新城疫的流行可能跟野鸟活动有关，为广东地区的新城疫的防控提供了理论支持。
在分析了广东地区新城疫流行的基本情况后，结合我国新城疫流行的主要特点及反向遗传技术的研究进展，本研究着手构建广东鸡源基因Ⅶ型NDV GM株的感染性克隆。为此，自行设计和构建了含T7启动子、终止子等元件及6型肝炎核酶序列（Rbz）的骨架质粒pCSX。在此基础上针对GM株基因组序列及限制性内切酶图谱，设计引物，通过PCR方法分段扩增出GM株的全长基因组，然后将各基因片段逐个按顺序装入骨架质粒中，最终获得了含GM株全长基因组的eDNA克隆pCSX-GM。将全长基因组cDNA克隆pCSX-GM与辅助蛋白表达质粒共转染预感染了可表达T7RNA聚合酶痘病毒的BHK-21细胞后，检测出文该病毒为新城疫毒，其序列测定结果与亲本毒株一致，命名为rGM株，所救获病毒的EIDso为10-6-5/0.2mL，ICPI为1.787，MDT为72 h，各项指标均与亲本毒株相近，为NDV基因功能的研究及新型疫苗的开发研制奠定了基础。