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采用可培养方法,以根际多功能益生菌——链霉菌S506和12年连作番茄土壤为试验材料,研究了在苗期、开花期和结果期,番茄植株根和茎内生细菌的群体结构和密度的动态变化,对分离获得的内生细菌资源进行了拮抗病原菌、产IAA、产铁载体、解有机磷、溶无机磷和固氮等生物功能的鉴定,对优势菌株进行了生物测定。1.筛选获得了功能互补的植物内生细菌分离培养基组合——富营养培养基NR和寡营养培养基R2A,两种培养基结合可分离内生细菌数量比经典的NA培养基增加了 20.97%,细菌种类增加了 160%。2.从番茄不同生长时期的根茎组织内共分离获得内生细菌166株,采用16SrDNA序列分析方法,明确其系统发育分属于已知的13个属,30个种,其中芽孢杆菌属14种,微杆菌属3种,泛菌属2种,葡萄球菌属3种,其他菌株8种。YT82号菌株的系统发育与最近的小孔芽孢杆菌(Bacillus foraminis)的相似度仅为95%,很可能是一株内生细菌新资源。3.S506介入番茄根系后,在番茄的不同生长时期,可培养内生细菌的总量、种群结构和优势菌群组成都发生了显著改变。(1)内生细菌总量显著提高,在开花期差异最大,根系和茎组织的内生细菌总量分别提高了 153.70%和118.78%,差异达极显著水平(p<0.01);其他时期的变化不显著。(2)内生细菌种群多样性显著提高,在开花期,S506处理根系和茎组织内生细菌的种类分别增加了 133.33%和160%。其他时期差别不显著。(3)功能细菌种群数量大幅度增加,根系产IAA、解有机磷、固氮、拮抗病原真菌和产铁载体功能细菌数量分别增加了 156.3%、155.6%、140%、100%和63.2%,茎组织内生固氮细菌和产铁载体细菌增加了 77.8%和70%。这与S506菌株介入根围后,表现出极显著的促进根系发育、提高植株生物量、显著提高防病功能具有密切关系。(4)根系可培养优势细菌菌群由单一的解淀粉芽孢杆菌占主导向菌群多样化转变。在开花期,对照根系解淀粉芽孢杆菌占分离总数的61%,S506处理则呈多样化分布,枯草芽孢杆菌占29%、解淀粉芽孢杆菌、污染短芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌等各占16%。茎组织优势菌群也由单一的巨大芽孢杆菌向解淀粉芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌占主导转变。(5)S506可抑制幼虫普罗威登斯菌、腐生葡萄球菌和肺炎杆菌等人畜条件致病菌和冰核细菌——成团泛菌和菠萝泛菌在番茄组织的定殖。4.以冬小麦种子为试验材料,从分离获得的内生细菌资源中筛选获得5株具有显著促发芽和促进幼苗生长的功能细菌,可使小麦种子发芽提早3h,对植株和根系干重分别提高52%和70%以上,叶片和主根长度都有显著提高,具有较大应用潜力。这5株细菌均分离自S506处理的番茄植株。