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深空探测是人类进行的航天活动中最重要的部分之一，是一个国家科学技术水平和综合国力的集中体现。在深空任务中，通信系统承担着传输遥测遥控指令、返回探测数据等关键工作。由于深空通信环境与地面通信环境的差异极大，使得传统的文件传输协议在深空环境下受到了极大的挑战。针对深空通信的特点，本文介绍了国际空间数据系统咨询委员会（Consultative Committee for Space Data Systems, CCSDS）提出的CCSDS文件传输协议（CCSDS File Delivery Protocol, CFDP）的系统结构以及通信流程，阐述了CFDP的五种传输控制模式，总结了CFDP文件传输协议的特点。并分析了CFDP协议的文件传输时延，同时根据仿真结果分析了CFDP相对传统FTP协议的性能优势并且分析了CFDP协议在深空环境中的局限性。当深空信道误码率上升，导致CFDP协议需要多次重发方能完成文件传输，交互次数的增加使得文件传输时延大大增加。近年来兴起的喷泉编码，作为一种前向纠错技术，因其具有的能够以任意概率逼近山农极限，无固定码率，且无需反馈的特性，被引入到深空通信中来。本文提出了基于喷泉编码的喷泉文件传输协议（Fountain File DeliveryProtocol, FFDP），给出了FFDP协议的系统结构与协议帧结构，描述了FFDP协议的工作流程，包括FFDP协议无确认模式以及确认模式。同时，分析了FFDP文件传输协议的开销与文件传输时延。FFDP协议通过在发送端引入额外的发送开销，来降低传输过程中的交互次数。经仿真验证分析，当单向传输时延较小时，CFDP协议的性能要优于FFDP协议。当单向传输时延增大时，FFDP协议的性能要优于CFDP协议。当单向传输时延较小时，数据发送总量决定了文件传输时延，当单向传输时延较大时，整个传输过程中的交互次数决定了文件传输时延。FFDP协议通过在发送端发送了额外的包开销，来减小整个传输过程中的协议交互次数，单向传输时延较大时，获得了较好的性能表现，适合于深空通信环境中。