目的:检测S100A9蛋白在肝细胞癌组织中的表达,并探讨其临床意义。方法:1.收集84例肝细胞癌患者的组织标本及相关临床病理数据。采用RT-q PCR法、免疫组织化学法以及Western blot法检测S100A9蛋白在肝细胞癌组织及相应癌旁组织中的表达;对采用RT-q PCR法检测的病例进行S100A9表达水平与肝细胞癌患者临床特征间的相关性进行统计分析。2.自GEO数据库收集整理具备S100A9表达水平的肝细胞肝癌病例资料,并统计分析S100A9表达水平与肝细胞癌临床特征之间的相关性。3.自TCGA数据库收集整理具备S100A9相对表达量的肝细胞肝癌病例资料,再运用KEGG数据库数据对S100A9行常见肿瘤信号传导通路进行基因富集分析。结果:1.IHC结果显示S100A9在细胞核与细胞质中均有表达,肝细胞癌组织中S100A9高表达率为66.67%（16/24）,相应的癌旁组织中S100A9的高表达率为37.50%（9/24）,差异具有统计学意义（P=0.043）;2.Western blot检测结果显示肝癌组织中S100A9蛋白的表达高于相应的癌旁肝组织,差异具有统计学意义（P<0.05）;3.RT-q PCR结果显示肝细胞癌组织中S100A9的表达量高于相应癌旁肝组织,差异具有统计学意义（P=0.0004）;Cox回归分析表明S100A9的表达水平是影响患者生存预后的独立危险因素（P=0.027）;高表达的S100A9与临床病理参数中的肝癌组织分化程度（P=0.028）、巴塞罗那分期（P=0.028）、门静脉转移（P=0.037）、肿瘤大小（P=0.028）相关,与年龄（P=0.795）、性别（P=0.781）、肿瘤结节数目（P=0.053）、血清AFP水平（P=0.573）、HBV感染（P=0.559）无关;高S100A9表达组较低S100A9表达组的总体生存期短（P<0.001）。4.GEO数据库资料统计分析显示肝细胞癌中S100A9的表达显著高于相应癌旁肝组织（P=0.025）;S100A9的表达量与临床病理参数中的肝癌大小（P=0.044）、TNM分期（P=0.017）、肺转移（P<0.05）、淋巴结转移（P<0.05）相关,与年龄（P=0.299）、性别（P=0.417）、肿瘤是否多发（P=0.841）、血清ALT水平（P=0.641）、血清AFP水平（P=0.132）、巴塞罗那分期（P=0.834）无关;高S100A9表达组的总体生存期短（P=0.013）。5.KEGG数据库单基因富集分析结果显示S100A9在JAK＿STAT（P=0.0220）及WNT（P=0.0039）两条信号通路中被富集。结论:S100A9蛋白在肝细胞癌组织中高表达,并且S100A9的高表达与肝细胞癌的分化程度、临床分期、肿瘤转移、肿瘤大小密切相关;通过GSEA分析,我们发现S100A9可能通过JAK＿STAT及WNT信号通路参与肝癌发生与发展;总体来说,我们的研究发现S100A9可能是肝细胞癌的潜在治疗靶点及评价患者预后的危险因素。