柴达木盆地达布逊盐湖微生物多样性研究

来源 :中国地质大学(北京) | 被引量 : 0次 | 上传用户:eclipse
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地球早期蒸发环境中具有高浓度的盐分和有机质,使得生活其中的微生物发育获得“耐盐”或“嗜盐”的生活习性,因此,研究咸盐环境下的微生物生存适应性对我们了解地球生物圈和早期生命演化具有重要的指示作用。此外,在咸盐环境的耐盐或嗜盐微生物具有广阔的生物工程应用价值。因此,在咸盐环境中开展微生物多样性研究具有重要的科学意义和现实应用价值。本研究选取柴达木盆地达布逊盐湖水样和表层沉积物样品,采用传统培养与高通量测序技术相结合的方式,研究微生物多样性特征。结果显示:(1)定量PCR结果显示,达布逊盐湖水体中的细菌和古菌16S rRNA基因丰度分别为3.27×107和4.35×104拷贝/mL。(2)达布逊盐湖中的细菌多样性与丰度远高于古菌。高通量测序所得的16SrRNA基因序列分别归属于广古菌门(Euryarchaeota)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia)。广古菌门序列占原核微生物(细菌与古菌之和)的5.5%,以嗜盐的盐杆菌科(Halobacteriaceae)为主,而属于放线菌门、拟杆菌门、变形菌门和疣微菌门的细菌序列分别占原核微生物的53.0%、25.8%、14.1%和1.6%。(3)培养分离获得的纯细菌菌株分别属于假单胞菌属(Pseudomonas sp.)和芽孢杆菌属(Bacillus sp.)。古菌菌株则分别属于盐杆菌科的盐盒菌属(Haloarcula sp.)、盐红菌属(Halorubrum sp.)和盐棍菌属(Halorhabdus sp.)。(4)从达布逊盐湖沉积物样品中分离得到一株嗜盐古菌CUG00001T,菌株CUG00001T与Halorhabdus utahensis DSM12940T的16S rRNA基因序列同源性为96%,并对其从多相分类学角度,通过形态学特征、生理生化特征、化学特征的系统鉴定,初步判断菌株CUG00001T是盐棍菌属Halorhabdus的新成员,并命名为Halorhabdus dabuxunensis。本研究为青藏高原盐湖微生物资源的开发和利用提供了有利的数据基础。
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