目前，我国真正意义的农民专业合作社发展很少。根据国际经验，合作社的本质特征是出资者与惠顾者的合一，其核心制度安排是“一人一票”的民主管理和按惠顾额返还盈余的利益分配，即“平权式”治理结构。而我国现有的大部分农民专业合作社，在制度特征上都介于传统合作社模式与股份制企业模式之间。为什么真正意义的合作社在我国难以产生和发展？　　现有的大量关于合作社发展影响因素的研究，主要集中在三方面，即客观经济政策环境、合作社内部的组织成本和制度安排、农户主体的参与合作意愿和集体合作行为。而从农民专业合作社赖以生存的制度土壤——农村制度安排的角度入手，研究外在制度环境对合作社发展影响的文献并不多见。乡村治理的模式是农村基本的制度安排，影响着村庄内部成员的决策和集体行为。　　本文的研究目标是，在前人研究的基础上，通过对山东、浙江两个典型农民专业合作社的调查，从乡村治理的角度入手，基于“精英+普通民众”的社会结构，应用经济学、博弈论等理论分析工具和案例研究方法，构建精英与普通民众互动的博弈模型，研究农村的制度环境对合作社内部制度安排的影响，进一步从制度层面对合作社发展给予新的诠释。　　通过理论分析与实证检验，本文得出如下结论:(1)农民专业合作社的发展受到农村制度环境的影响。实行精英治理的村庄为合作社内部的精英控制提供了存在的合理性;实行村民自治的村庄为农民专业合作社内部的“平权式”治理结构提供了生存发展的基础。(2)农民专业合作社的股金结构影响合作社的治理结构，治理结构通过利益分配机制影响合作社全体社员的整体效用。(3)精英和普通民众的实力对比，以及普通民众之间的凝聚力，共同影响着乡村治理模式的选择。　　最后，结合结论，为我国农民专业合作社的健康快速发展提出了政策性建议。