新一代中草药信息系统的设计、开发与相关应用方法研究

来源 :北京大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dickensking
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该论文围绕基于中草药的信息系统设计开发以及相关应用方法进行深入研究.在博士论文期间开发了系列的基于中草药信息的数据库系统,并结合神经网络技术开展了信息系统应用的初步研究工作.整个论文包括两部分内容.第一部分包括CHDD系列数据库系统的设计与开发.开发第二代中草药结构数据库系统(CHDD v2).其设计思想体现以中草药植物中提取的化合物结构为主,来源植物等其它信息为辅的特点.数据库系统遵循Client/Server模型.后端全新设计的表结构,有效地解决了复杂的表间关系的存储和检索问题,具有很强的可扩充性.目前数据库已经收录化合物记录一万余条,来源植物信息两千余条.其次,我们采用独创的设计思想开发了新一代中药信息系统CHDDX v3.突破了传统思维的束缚,把原有系统结构模式转变为将化合物结构、来源植物、方剂信息这三类子库的地位并驾齐驱,而且融合成有机的整体,突出集成与均衡的特点.目的是探索一条使用分子生物科学和生命科学阐释中药作用机理和使用原则的新路.在数据库规模上,目前已经收录六千余条中草药植物信息和七百余条经典方剂信息,而相应的化合物记录数也随之迅速增长.此外,改进的客户端显示界面,全新设计的检索引擎,完善了从中药方剂,到中草药植物,再到成份分子这种基于中草药的计算机辅助药物整体设计思路.第二部分包括了与信息系统的相关的应用方法研究.我们在国内率先开展药物分子ADME性质预测建模的计算方法研究.其中,使用反向传播(BPNN)和通用回归网络(GRNN)两种神经网络方法对当前ADME研究中的一类热点问题,药物分子穿透脑血屏障的能力(BB),进行QSPR建模,并取得很好的效果.该模型可以配合中药药动学的研究,而且在数据库搜索等诸多计算机辅助药物设计领域中具有广泛应用前景.
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