依赖并购提升自身竞争力是目前企业经营的一大趋势，然而我国医药行业经历的并购热潮却并未引起应有的正面效应。我国医药行业在2002-2005年间共发生156起并购事件，而2006年的行业亏损率却高达22.62％，导致这种状况的原因究竟在于人们对并购作用的过分“神化”还是公司自身的内部治理问题?针对这一疑问，本文以医药行业上市公司为研究对象，以主成分分析法为主要研究方法，深入剖析并购对代理成本及绩效的影响，旨在客观分析我国医药行业并购效应，为行业发展提供理论依据和现实思考。　　 文章共分七章进行论述。第一章介绍了本文的研究背景、界定了研究问题，并对文中应用的重要概念进行了解释。第二章对并购动机、并购绩效的相关研究成果进行了总结，发现控制权转移对目标公司绩效提升有正向影响。第三章详细介绍了代理成本的含义、测度和产生原因，认为所有权和控制权分离是代理成本产生的根本原因。第四章则尝试寻找代理问题的解决机制，在内控机制无效的情况下，并购提供了一种解决代理问题的外控机制。第五、六章对医药行业上市公司进行实证分析，判断并购前一年至并购后三年期间目标公司绩效和代理成本的变动情况，对结果进行分析并提出建议。第七章对本文的研究成果进行了总结。