我国近年来在中央和地方陆续推行的部门预算改革，在整个财政体制改革中起着基础性的作用。南京市部门预算改革自2000年开始，七年来由点到面，逐步推开，取得了可喜的阶段性成果。但与此同时，由于诸多内外因素的影响，部门预算改革存在不少难点和问题，如果不及时研究解决，将在很大程度上制约着部门预算改革目标的实现，进而影响与社会主义市场经济体制相适应的公共财政体制的构建。笔者作为一名在南京市财政部门工作的干部，具有从事部门预算管理工作的切身经历和体会，因此，选择了部门预算改革这一课题，从研究构建公共财政管理体制背景下，部门预算改革的必要性和意义入手，运用历史分析、系统分析、比较分析、数据分析等研究方法，深入分析了南京市部门预算改革的实施历程、具体做法以及取得的成效，全面探讨了部门预算实际运行中存在的难点和问题，并分析难点和问题的成因，从改革的外部环境、外部监督制约和改革的内部运行机制三个方面，提出了顺利推进南京市部门预算改革、加快建立公共财政管理体制的对策，力求理论联系实际，使得出的结论具有一定的实用价值和可操作性，促进南京市预算管理的科学化、规范化、法制化，为构建与我国市场经济体制相适应的公共财政管理体制奠定坚实的基础。　　 部门预算作为一种国际公认的良好的预算管理模式，是当前预算管理体制改革的最重要环节，是构建公共财政管理体制不可逾越的基础性制度平台，改革不仅势在必行，而且具有重要的理论意义和现实意义。南京市自2000年以来的部门预算改革，克服了传统预算的弊端，从部门预算编制原则、编制方法、基础平台和配套改革等方面，建立了部门预算管理的基本框架，不仅优化了公共支出结构提高了政府财力配置效率，而且强化了政府部门的预算观念和依法理财观念，增强了预算的约束力，提高了预算透明度，促进了预算编制和管理的公开、公平、公正，促进了财政资金的分配、使用走向法制化、规范化。但是，由于传统管理模式、经济发展水平、现行管理体制、现行利益分配格局以及预算法制化程度等因素的制约和影响，以及监督制约机制尚未健全，现阶段的南京市部门预算在编制、执行、监督、评价等环节，都不同程度地存在着一些难点和问题，主要体现在：在外部环境中，政府行政运行成本难以降低，部门既得利益格局与部门预算改革矛盾难以调和，现行预算会计制度与部门预算不相适应，现行预算编制法规与部门预算存在一些冲突，部门预算的相关配套改革尚未完善；部门预算的外部监督制约机制很不健全，人大、审计部门、社会公众对部门预算的监督都没有到位；在内部运行机制中，信息不对称使财政部门在预算分配中比较被动，现行政府预算收支科目体系不合理，预算年度与预算审议时间不同步，难以全面按照“零基法”编制部门预算，缺乏有效的项目预算编制和管理方法，难以建立部门预算绩效考核评价机制。　　 面对上述难点和问题，只有积极地分析和研究，才能找到化解的途径。在现阶段，应针对部门预算改革外部环境中的制约因素，加快部门预算改革的配套改革，控制和逐步降低政府行政成本，增强政府调控能力，打破部门既得利益格局，修订完善现行的预算会计制度体系，深化国库集中收付制度和政府采购制度改革，实现部门预算管理的法治化；针对部门预算监督制约力量的弱化，着重完善其外部监督制约机制，促使人大充分履行对部门预算的法定监督职能，加大政府审计部门的专业化监督力度，建立健全社会公众的民主监督机制；针对部门预算内部运行机制中的难点，应加快构建科学、合理的政府预算收支科目体系，适当延长预算编制时间，建立标准预算周期制度，在观念、技术、管理等方面的关键环节进行实质性的探索，提高零基预算的编制效率，完善项目支出预算管理机制，实现项目库常年滚动管理，建立科学、适用的部门预算支出绩效评价体系，为编制绩效预算创造良好的基础。