狂犬病毒野毒株G-L间隔区及L基因活性部位序列分析

来源 :吉林农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:liyunlong1015
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狂犬病是由狂犬病病毒及狂犬病相关病毒所引起的一种人兽共患的烈性传染病。几乎所有的温血动物都对狂犬病病毒感染,狂犬病一旦发病,死亡率达100%,全世界每年约有55000人死于狂犬病。近年来随着分子生物学的发展和应用,对狂犬病毒基因结构、基因序列及其主要功能以及发病和免疫机制等都有了新的认识和了解。本研究为了丰富我国狂犬病基因库,对我国不同动物中分离到的两个野毒株进行基因组部分序列的测定和分析。 本实验对狂犬病病毒野毒株MRV、DRV的G-L间隔区(IGR)以及L基因聚合酶活性部位进行了克隆和测序,将所测定的结果和推定的氨基酸序列与国内外公开发表的狂犬病病毒其它固定毒株、野毒株和同科不同属的病毒的相应部分进行了分析比较,结果表明MRV、DRV G-L IGR核苷酸序列的同源性为83.3%,与其它毒株的同源性在58.3%~91.7%之间;狂犬病毒G-L间隔区序列的长度在弹状病毒科不同病毒属之间有所不同。根据G-L IGR有无插入基因可以将弹状病毒科可以分成两大类,一类是G-LIGR中没有插入基因的狂犬病病毒属和水疱性病毒属,另一类是G-L IGR有1-6个插入基因不等的弹状病毒属和暂时热病毒属。本文推测这可能是病毒在长期进化中不同病毒对不同宿主细胞适应性的结果。 MRV、DRV的L基因聚合酶活性部位核苷酸序列同源性为100%,与其它毒株核苷酸同源性在83.2%~100%之间,推定的氨基酸同源性在83.8%~93.8%之间。在L蛋白的672、681和745位的氨基酸MRV、DRV与其它毒株不同,L基因活性部位序列相对保守,有利于聚合酶活性的稳定。
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