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随着我国创新型国家建设发展的深入，科技创新体系中高校的重要性与日俱增，所占比重也逐年增加，随之而来的是国家对高校科研资源的投入不断增加。然而，我国高校科研投入产出效率不高，科研活动呈现出粗放型发展模式。对此高校面临着如何合理的利用科研资源，以及如何提高科研效率的问题。高校科研投入产出效率的研究，可以帮助高校改善科研管理，促进高校科研的发展，因此，有必要对高校科研投入产出效率进行相关的研究与分析，以此为高校科投入产出效率的提高提供方向和相关依据。 本文采用数据包络分析方法（DEA），以河北省 13 所重点骨干高校为研究对象，对这些高校进行DEA有效性分析，并对非DEA有效的高校进行投入冗余和产出不足分析，找出改善的措施，采用基于 DEA 模型的 Malmquist 指数对这些高校进行跨期生产效率研究，以期对这些高校进行科研投入产出效率的静态和动态的全面研究，得出相关结论： 1.在对河北省13所重点骨干高校进行DEA有效性分析时，发现有8所高校属于DEA有效，占总数的61.5%，有5所高校属于非DEA有效，占总数的38.5%。在规模效率方面，有8所高校处于规模报酬不变的状态，达到了理想状态；有5所高校处于规模报酬无效的状态，其中1所高校处于规模报酬递减的状态，4所高校处于规模报酬递增的状态。 2.根据投影分析原理，对非 DEA 有效的高校进行分析，找出其中的投入冗余和产出不足的方面，并计算投入方面可减少的数量和产出方面可增加的数量，并根据 DEA模型的相关原理计算出可改善的目标值。 3.利用基于DEA模型的Malmquist指数对这些高校进行跨期生产效率研究，这些高校的科研投入产出效率整体呈上升趋势。2011-2016年河北省13所重点骨干高校生产效率变动的主要原因是技术进步指数的变动。