良好的公司治理结构作为在经济全球化市场上的一种竞争优势，作为可持续增长和发展的一个不可缺少的重要组成部分，其建设和优化是一个全球性关注的焦点问题。目前，我国科技型中小企业在建立现代公司治理制度方面虽然取得了显著的进展，但依然存在着挑战。　　 本文从公司治理基本理论入手，首先运用规范分析方法介绍了科技型中小企业公司治理结构的理论基础，并对公司治理结构与绩效的关系进行了理论分析，提出了科技型中小企业治理结构与绩效关系的相关研究假设；然后以2009年12月31日之前在深市中小板上市的科技型中小企业为研究样本，以2007-2009年度为时间窗口，在收集大量数据的基础上，采用描述性统计分析法、因子分析法和面板数据模型等实证方法，对在深市中小板上市的科技型中小企业治理结构和绩效的关系进行了实证研究。实证研究的结果表明：股权集中度、高管薪酬激励、高管股权激励和两职合一与公司绩效正相关。股权制衡度、董事会规模和独立董事比例与公司绩效不存在显著相关关系。最后本文基于研究结果提出了一些针对性的管理建议。