制造业是我国混合所有制改革的重心和先导，是经济转型发展的关键拉动力量。制造业要实现成功转型必须依靠不断提高研发投入强度、完善研发投入结构。公司治理作为现代企业制度的基础，是企业进行研发活动的制度基础，对研发活动决策和推行起关键作用。那么，企业应如何完善公司治理从而提高制造业企业研发能力己成为国内学者较关注的问题。　　本文以2014-2016年沪深A股制造业混合所有制上市公司为样本开展研究。首先，分析了制造业混合所有制企业公司治理及研发投入现状:其次，分析公司治理各个层面对研发投入影响的机理:最后分别从内部治理和外部治理两个方面实证研究国有控股和非国有控股企业的公司治理各个层面对研发投入的影响。　　研究结果表明:(1)国有控股样本企业股权混合度与研发投入呈正“U”型关系，且其拐点为46.03%;(2)董事会规模与研发投入的关系在国有控股及非固有控股样本企业均为负相关；(3)非国有控股企业独立董事比例与企业研发技入为倒“U”型关系，当独立董事比例在0-43.07%区问时琅、独立董事比例的提高对企业研发投入有正向影响，而国有控股样本企业中，二者无显著关系；(4)高管货币性薪酬和权益性薪酬对研发投入的正向影响在国有控股和非国有控股样本都得到了验证；(5)非国有控股企业长期薪酬强度与研发技入正“U”关系，其拐点为43.38%，国有控股企业不存在这种显著关系；(6)无论是国有控股还是非国有控股的样本企业，债权人参与公司治理的能力越强，越不利于企业开展研发活动；(7)无论在何种产权性质的企业，政府干预程度越高，企业研发投入越高，且这种影响在国有控股企业更加明显；(8)在两种产权性质的样本企业，激烈的产品市场竞争不利于企业研发投入的提高。　　最后，根据实证研究的结果，提出建立多元股权结构、完善董事会治理机制、构建更加合理的高级管理人员激励和约束机制、建立完善且合理的外部治理环境等对策建议。