胰腺癌中microRNA表达研究

来源 :中山大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:w7kny6194i
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
胰腺癌是起源胰腺外分泌腺恶性程度很高的肿瘤,发病率在国内外均呈上升趋势。临床资料显示:胰腺癌发病率占消化道恶性肿瘤的8%~10%,占全身各种恶性肿瘤的1%~4%。胰腺癌甲.期症状隐匿,无典型临床症状,当患者出现典型的临床表现时,多已是晚期。现有临床诊断和治疗措施总体效果欠佳,患者五年的临床牛存率为0.18%~23%。近年来,流行病学研究显示:胰腺癌在我国的发病率呈上升趋势,严重威胁国人的健康和生命。所以,对胰腺癌发病机理深入的研究迫在眉睫,同时对胰腺癌发病机制的研究也将为胰腺癌临床诊断和治疗提供帮助和支持。 MicroRNA简称miRNA,是新近发现的一类含有18~25个核苷酸不编码蛋白质的RNA,成熟的miRNA通过特异的识别其相应的靶基因,降解或抑制靶基因的mRNA的表达,调控细胞分化,增殖和调亡等。目前,越来越多的研究证实miRNA在肿瘤的发牛和发展中起着重要作用,而且miRNA表达情况可以预测肿瘤的恶性程度和肿瘤病人的预后。为探索miRNA的在胰腺癌中表达情况及其作用,我们做了以下研究工作。 本课题分为三个部分:1.胰腺癌中miRNA的表达谱;2.胰腺癌中miRNA的Real ime RT-PCR验证;3.胰腺癌中miRNA靶基因的生物信息的研究。 第一部分胰腺癌miRNA表达谱 应用miRNA基因芯片,检测胰腺癌中miRNA表达情况,筛选出在胰腺癌中明显上调或下调的miRNA进行进一步研究。 方法:提取4例胰腺痛组织和对应的胰腺正常组织RNA以及人胰腺癌细胞株和人胰腺正常导管上皮细胞中RNA,利用miRNA基因芯片检测胰腺癌中mciroRNA的表达情况。 结果:1.在组织中表达上调大于两倍的miRNA有:miR-18l、miR-1、miR-325、PREDICTED-MIR-206、miR-101、miR-10b、PREDICTED-MIR-166、miR-100、miR-338。下调大于两倍的miRNA有:miR-542-5p、miR-216、miR-200c、miR-557、miR-503、 miR-217、 miR-31、 miR-572、 miR-660、 miR-200a、 miR-296、PREDICTED-MIR-143、miR-182、miR-373*、 miR-152、 miR-424。PREDICTED-MIR-206、PREDICTED-MIR-166、PREDICTED-MIR-143位计算机预测出来的miRNA。上调表达差异最大的是miR-181,为10.4倍。下调中表达差异最大是miR.542-5p,为6.2倍。在细胞系中上调两倍以上的miRNA:miR-214、miR-125b、miR-184、miR-17.5p、miR-526b、miR-526c、miR-512-5p、miR-3l、miR-130a、miR-222、miR-194、miR-29a。下调大于两倍的miRNA有:let-7i、miR-299.3p、miR-103、miR-453、miR-22、miR-103、miRl07、miR-30d、miR-27a、miR-218。其中上调表达差异最大的是miR-214,上调倍数为11.11,下调表达差异最人为let-7i,下调倍数为89.1下调。 结论:通过miRNA基因芯片筛选miRNA在胰腺痛肿瘤组织和胰腺正常组织以及胰腺癌细胞和胰腺正常细胞表达差异,我们得出miR-181和miR-214可能是胰腺癌中表达较特异的miRNA。 第二部分胰腺癌中miRNA表达的Real-time RT-PCR验证 从上述miRNA基因芯片的结果我们得出miRNA在胰腺癌中的表达谱。结合实验结果和相关文献,我们选择上调差异较明显的miR-214,进一步验证miRNA基因芯片的结果。 方法:提取胰腺癌细胞和胰腺正常导管上皮细胞总RNA,采用探针法应用实时定量逆转录一聚合酶链反应检测miR-214在肿瘤细胞和正常细胞表达差异,以U6作为内参照。进行Real time PCR反应。 结果miR-214在胰腺癌中表达明显上调,证实miR-214在基因芯片中的表达结果真实可靠。 结论:miR-214在胰腺癌中表达上调,可以作为胰腺癌miRNA表达谱中上调特异的基因。 第三部分胰腺癌中miRNA靶基因的生物信息学研究 应用牛物信息学的方法查找miR-214靶基因并对其进行在分析。 方法:利用PicTar、TargetScan、MiRana等算法在网络上中查询与胰腺癌相关的miR-214的靶基因。 结果:查询到miR-214的靶基因约有700个,这些基因与细胞增殖,细胞凋亡,细胞分化,细胞周期,细胞信号转导,细胞迁移等相关。 结论: miR-214可能通过调控细胞的增殖、凋亡、分化,周期,信号转导,迁移相关的基因影响肿瘤的发牛和发展。
其他文献
目的 对高海拔地区慢性肺源性心脏病并发心律失常患者临床治疗方法进行研究.方法 对我院收治的慢性肺源性心脏病并发心律失常患者临床资料进行回顾性分析,总结临床治疗方法,
文中将煤巷顶板结构类型划分为整体结构、块裂结构、碎裂结构、板裂结构和散体结构,简述了不同顶板结构类型的结构面性质、破坏特点及相应的支护设计原则。 In this paper, t
Objective: To investigate whether administration of genistein can improve hormonal changes (estradiol and follicle stimulating hormone (FSH)] , heat shock prote
介绍了RFPA′98 数值模拟计算软件的特点和计算方法,并结合湘西金矿深部无间柱连续开采技术研究课题,建立了采场数值模拟计算模型,分析了采场的稳定性.通过计算,准确模拟了采场回采过程
今年初,山东省委组织部对2010年度重点调研课题成果进行了评审,评选出了一批优秀调研成果。这些调研成果涵盖了组织工作的各个方面,具有很高的参考价值。现将部分调研报告摘
期刊
期刊
近日,中共中央组织部发出通知,颁布修订后的《党政领导干部公开选拔和竞争上岗考试大纲》(以下简称《考试大纲》)。《考试大纲》是与《党政领导干部选拔任用工作条例》和《公
1引言一次某高校一位外教在黑板上写了句孔子的话,问这是谁说的,全班没人能作出正确的回答。国内某高校一知名教授说,问学生从理科大楼到北大西门怎么走,结果没一个能说得既
采用模糊数学及层次分析相结合的方法,考虑锚喷支护的现有经验,提出了锚喷支护工程类比设计的模糊经验分析法.研究表明,提出的方法使现行工程类比定性设计成为定量化设计,减少了常