鹅IGF-Ⅰ基因部分序列克隆及变异与生长、屠宰性能的关联性

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:w332365605
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胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)是一类广泛存在于机体多种组织中的蛋白多肽,是动物体内重要的调节因子之一。其主要的生理功能之一是介导生长素的促生长作用,调节动物生长。本研究以皖西白鹅和朗德鹅作研究素材,采用比较基因组学方法,以鼠、猪、鸡等比较保守的基因区域,应用Dnastar和Primer Premier 5.0软件,设计引物对鹅的IGF-Ⅰ基因5’端非编码区和外显子4序列克隆测序,并进行同源性分析;运用SNP技术检测克隆片段,通过不同基因型间生长和屠宰性能的比较,探讨影响鹅生长性能的主效基因的基因型。克隆了皖西白鹅和朗德鹅IGF-Ⅰ基因5’端非编码区序列和外显子4序列(GenBank登录号:EF382668;EF460850)。序列比较分析表明,皖西白鹅5’端非编码区序列与朗德鹅完全相同,与家鸡同源性为94%,与猪的同源性为79%。鹅外显子4与鸡的同源性为82%。PCR-SSCP检测结果表明:IGF-Ⅰ基因5’端非编码区序列在pro1、pro2共有四个SNP位点,分别是:A-26T,A-215G,A-314G,A-325T;外显子4片段经SSCP检测不存在多态性。应用TFSEARCHver1.3软件对IGF-Ⅰ基因5’调控区潜在的调控元件和蛋白结合因子预测发现:A-314G,A-325T两个位点的碱基变异导致蛋白转录结合因子发生改变,其中A-314G变异使5’调控区增加一个NⅢ-2结合位点与之结合;而A-325T碱基变异增加了Hb、GATA-2、GATA-Ⅰ蛋白转录结合因子。群体遗传分析表明,皖西白鹅Pro1引物检测的两个等位基因,频率分别为0.82和0.18,AA、AB、BB基因型频率分别为0.69、0.26、0.05;Pro2引物检测的两个等位基因频率分别为0.74和0.26,CC、CD、DD基因型频率分别为0.54、0.39、0.08;群体在两位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。朗德鹅Pro1和Pro2引物检测的等位基因频率分别为0.16、0.84和0.29、0.71;AB、BB和CD、DD基因型频率分别为0.33、0.67和0.65、0.35;经?~2适合性检验,朗德鹅群体在两位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态。对皖西白鹅的生长与屠宰性状与其IGF-Ⅰ基因5’侧翼调控区的多态性位点关联分析表明:CC基因型6、8周龄体重、半净膛重、胸肌重与DD基因型的差异显著(P<0.05),CC基因型的肝重与DD基因型的差异极显著(P<0.01),因此,可将DD基因型的位点作为鹅提高早期生长性能的分子标记
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