油茶种质资源AFLP体系的建立和优化

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本研究以湖南、广西和广东等地选出的油茶优良无性系为材料,对采集到的40个样品进行了适用于AFLP分析的DNA提取和纯化方法的研究,AFLP分析体系的建立和优化以及引物的筛选。获得的主要结果如下: 1.以油茶的成熟叶片为材料提取DNA,40个样品用改良的提取纯化方法成功提取出适用于AFLP分析的高质量DNA,OD260/OD280在1.7-2.0之间,可以用于AFLP反应。该方法打破了仅能用幼嫩叶片作为提取材料的限制,具有更广泛的适用性和重要的实用性。 2.本试验通过对样品AFLP反应体系及程序中影响因素的分析,建立和优化了AFLp反应体系及程序:在30μl酶切体系中,采用EcoR I和Mse I双酶切,37℃,6 h;40 μl连接体系,22℃,10 h以上或过夜,连接产物稀释20倍,-20℃保存。20μl预扩增体系中加入稀释20倍的连接产物5 μl,95℃预变性4 min,95℃变性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸2 min,30个循环,预扩增产物稀释30倍用于选择性扩增;25 μl选择性扩增体系中加入2 μl稀释30倍的预扩增产物,95℃预变性4 min,从65℃开始,相差0.7℃梯度降温,每梯度45 s,55.9℃退火45 s,72℃延伸2 min,13个循环,再95℃变性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸2 min,24个循环;选择性扩增产物,加5 μl Loading Buffer,95℃变性5 min,立即冰浴;在6%变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳,银染法检测PCR产物,或用2%~3%的琼脂糖凝胶电泳检测。 3.从E-ACT、M-CAA等64对3×3随机引物中筛选出4对扩增多态性较高,带型较清晰的引物组合。筛选出的4对引物组合为M-CAT+E-AAC,M-CAA+E-ACG,M-CAG+E-AAC和M-CTA+E-AAC。
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