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利用153个随机引物对乌珠穆沁羊、德国美利奴羊、内蒙古细毛羊以及由内蒙古细毛羊为母本，乌珠穆沁羊为父本的杂交后代，共28只绵羊个体的基因组DNA进行RAPD分析。其中38个随机引物可以扩增出清晰的RAPD带型，17个随机引物可扩增出多态性片段。17 个多态性引物共得到扩增片段122 条，每个引物扩增出的片段数在4～12条之间，平均每个引物扩增出 7条DNA片段，片段长度在500～2000bP 之间。结果表明，群体内遗传变异指数分别为0．3008、0．1431、0．2469 和0．3074，群体平均遗传多样性指数为0．3822。遗传多样性在群体内所占的比例为0．6535，在群体间所占比例为0．3465，因此，其遗传多样性主要分布在群体内。各群体的遗传距离在0．0755～0．1887之间，乌珠穆沁羊与内蒙古细毛羊的亲缘关系最近，杂交后代与德国美利奴羊的亲缘关系最远。各群体间的聚类关系与各群体间的亲缘关系基本一致。