牙鲆（Paralichthys olivaceus）是中国、日本和韩国等国家重要的海水经济养殖鱼类之一,在渔业生产中占有非常重要的地位。然而,牙鲆养殖业飞速发展的同时,高密度集约化养殖提升了牙鲆的死亡率,其生长速度也大大降低,使牙鲆养殖业的经济遭受了一些损失。因此大力发展牙鲆优良品种选育和家系选育工作,进一步提高产量和品质具有重要的现实意义。本文取得了以下结果:1、本研究利用已建立的牙鲆核心群体建立42个牙鲆家系,分别测量140、170、200、380日龄各家系生长相关性状（体重,全长,体宽）,通过MINQUE、REML和BLUP方法对其进行数量遗传分析。结果显示:不同时期生长性状的变异系数为10.56%-38.62%,其中体重的变异系数最大,全长和体宽的变异系数都比较小,不同的性状的变异系数均随着日龄的增加而减小。3个性状的加性方差分量比率为0.13±0.014-0.29±0.064,随机方差分量比率为0.71±0.064-0.87±0.014,狭义遗传力为0.13±0.014-0.29±0.064,广义遗传力为0.15±0.014-0.54±0.064,以上遗传参数均达极显著性水平（P<0.01）。综合比较3个性状的不同时期的遗传效应结果发现F0990,F1005,KS和F0719等4个群体亲本都为极显著正向效应,F0751,F0768,F0780,F09121,F0927和RS等6个群体亲本都为极显著负向效应（P<0.01）,其余的亲本均为一般效应。表型相关系数在0.82-0.96之间,遗传相关在0.72-0.97之间。利用BLUP方法对380日龄测量的数据进行育种值估算,结果发现亲鱼体重育种值为14.63-100.05,其中体重育种值最高的亲鱼个体为:F1005-8、F09119-11、F09125-4、F0915-57、F09104-12、F1264、F0908-38、F0927-20、F1005-53、F0990-6、F09125-7、F0751-14和F1005-42。家系平均体重育种值为20.87-35.6,其中平均体重育种值最高的家系为F1416、F1428、F1442、F1418、F1427、F1408、F1402、F1412和F1446。体重育种值选择比其表型值的选择效率高81.91%。本研究为牙鲆优良家系的建立及新品种的培育筛选出了性状优良的亲本和家系,同时为牙鲆育种计划的制定提供了重要理论依据。2、由于牙鲆雌雄个体差异明显,因此对牙鲆性别进行QTL定位。成功构建22个连锁群。整合图谱的观测总长度为994.34cM,平均间隔为10.81cM,连锁群上的标记数为2-9个,覆盖率达到了82.09%。共定位出5个与牙鲆性别相关的区间,分别位于第8、第15、第19和第23连锁群上,其中qGT-m8最高LOD值为9.83,覆盖区域为33.3-36.0cM,可解释表型变异率为75.3%,相邻的左侧标记是scaffold2₂20,相邻右侧标记为scaffold582₃195。qGT-f15最高LOD值为9.8,覆盖区域为44.7-46.1cM,可解释表型变异率为80.91%,相邻标记左侧是scaffold581₃651,右侧标记是scaffold526₄9786。qGT-f19定位出2个区间,最高LOD值为13.6,覆盖区域分别为0.1-5.8cM、28.3-29.1cM,可解释表型变异率为69.12%、78.57%,第一个区间相邻的左侧标记是scaffold307₃4397,右侧标记为scaffold1249₇7184,第二个区间相邻的左侧标记是scaffold247₂8440,右侧标记为scaffold599₅4404。qGT-f23最高LOD值为71.25,覆盖区域为1.1-6.1cM,可解释表型变异率为88.96%,相邻的左侧标记是scaffold1028₅334,右侧标记为scaffold1058₇3722。研究结果发现19号连锁群与性别相关基因相关性最大。通过对19号连锁群加密重新构建连锁图谱定位,整合图谱中有22个标记表现为连锁,总长度为147.70cM,平均距离为6.71cM,覆盖率为84.04%;雌性图谱中有18个标记表现为连锁,总长度达96.5cM,平均距离为5.36cM,覆盖率为80.97%;雄性图谱中有16个标记连锁,总长度为91.67cM,平均距离为5.73cM,覆盖率为81.04%。应用整合图谱定位到3个QTL区间,长度分别为8.4cM、4.1cM、2.2cM;应用雌性图谱定位到3个QTL区间,长度分别为3.6cM、1.2c M、1.2cM,应用雄性图谱定位到0个QTL区间。研究结果为进一步探索性别相关基因提供了参考区间。