目的 探讨沙眼衣原体（Ct）套式聚合酶链反应（nPCR）、DNA纯化、测序的检测方法；首次建立Ct上游引物5′末端地高辛(Dig)标记裂解酶片段长度多态性（CFLP）分型方法并探索和优化Ct主要外膜蛋白（MOMP）基因（ompl）第Ⅳ可变区（VDⅣ）变温CFLP条件;了解重庆地区近年来临产孕妇Ct感染和母婴垂直传播状况及常见基因型。方法 取重庆市妇幼保健院2003年4月~2004年2月临产孕妇宫颈刮片及其新生儿鼻咽部拭子组成母婴配对标本300对共605份，采用Ct ompl套式聚合酶链反应（ompl-nPCR）和用内套引物直接扩增（ompl–PCR）及共有质粒（plasmid）-PCR检测Ct，用扩大金标准判断结果；用透析袋电泳洗脱法纯化DNA；用ABI PRISM 377型全自动DNA 测序仪测序；首次建立上游引物5′末端Dig标记CFLP方法并进行临床Ct分离株的基因分型。结果 ompl-nPCR和ompl-PCR最低检测限分别为2.5EB和25EB，即前者比后者灵敏度高10倍。其敏感性分别为100%（33/33）和87.9%<WP=6>（29/33），特异性分别为99.6%（266/267）、99.3%（265/267）。孕妇宫颈Ct检出率为11%（33/300），其所生的305例新生儿Ct阳性8例，母婴传播率24.2%（8/33）。生后24h内和5~10d采集宫颈Ct阳性母亲所生新生儿鼻咽部拭子标本各33份和18份，检出Ct阳性1例和7例,检出率分别为3.0%（1/33）和38.9%（7/18），χ2=5.73，P<0.025。33例Ct阳性孕妇，剖宫产24例，其子 Ct阳性2例，剖宫产母婴传播率8.3%（2/24）；阴道分娩9例，其子Ct阳性6例，阴道分娩母婴传播率66.7%（6/9），χ2=4.43，P<0.05。在Ct阳性和阴性孕妇中，胎膜早破发生率分别为30.3%（10/33）和13.5%（36/267），χ2=4.2，P<0.05。PCR产物经透析袋电泳洗脱法纯化后，电泳条带清晰、没有非特异显影，起始部没有杂质残留，19例临床标本用分光光度法测纯化DNA浓度为0.1μg/μl ~0.25μg/μl，全部达到测序和进行CFLP分析要求。8对Ct阳性母婴配对标本CFLP图谱呈四类，经测序证实分别为E、F、H、D型（各3、2、2、1对），分别占37.5%、25%、25%和 12.5%，且每对母子CFLP图谱完全一致；同一标本不同批次产生的CFLP图谱和相同基因型的不同标本的CFLP图谱相同，显示出良好的重复性；本实验显示Ct ompl VDⅣ CFLP条件以8%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、40℃退火温度、10min~15min酶切时间获得的电泳图谱效果较为理想。结论 本实验结果在一定意义上反映了重庆地区近年来临产孕妇Ct感染和母婴垂直传播状况及常见基因型；上游引物5′末端Dig标记Ct ompl VDⅣ CFLP基因分型方法具有灵敏度高、重复性好、操作<WP=7>简便、快速、花费相对低廉，没有放射污染等特点，是一种极具潜力的Ct基因分型方法。