随着经济的不断发展,我国资源环境与社会发展之间的矛盾日益突出。水资源,更是众多资源当中最为重要,也是如今最为稀缺的自然资源之一。为了解决水资源时空分布不均的问题,我国修建了一系列的调水工程,然而受水区在享受调水工程带来的干净清洁的水资源并创造巨大的经济效益时,调水区不但不能从中受益,反而承受着巨大的水资源保护成本。在此背景下,生态补偿已经成为促进可持续发展的必然选择。本文在总结国内外研究和实践的基础上,首先从经济学和生态学等角度探讨了进行生态补偿的理论基础和必要性,并从其理论基础出发概括得出生态补偿实践应遵循的公平、受益者补偿和科学合理的原则,阐述了调水工程生态补偿的内涵。其次,在总结归纳生态补偿标准制定常用方法的基础上,本文从受益者补偿原则出发,提出以水资源安全突变模型分析受水区缺水状况,并由投入产出分析得到的水资源影子价格确定缺水经济损失,为费用分析法确定生态补偿标准提供依据和支撑。以南水北调受水区北京市为实例进行了验证,得出了生态补偿标准与调水带来的经济效益的比例关系,佐证了补偿标准的实用性。随后,对调水工程生态补偿机制的构建过程进行了梳理,对主要的生态补偿模式进行了总结归纳,就市场模式下结合受水区水资源供需平衡和投入产出分析确定生态补偿标准的必要性进行了阐述,并提出进行生态补偿效果评估的重要性。最后,基于实例研究中遇到的问题,对生态补偿领域进一步研究的方向进行了总结和归纳,提出生态补偿费用转移模式是未来研究的热点。