稻属AA-基因组物种性状变异分析和假稻叶绿体基因组测序

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稻属AA-基因组物种由于长期适应多变的自然环境,在重要的农艺性状上有着较大的变异,为栽培稻的育种提供了丰富的优异基因。以在西双版纳州景洪市基地种植的219份稻属AA-基因组8个物种为材料,通过对稻属AA-基因组8个物种的15个重要农艺性状进行观察和测量,分析统计了稻属AA-基因组8个物种9个数量性状(芒长、穗长、一次枝梗数、二次枝梗数、每穗谷粒数、株高、叶舌长度、剑叶长和剑叶宽)和6个质量性状(柱头外露、剑叶张角、株型、穗型、叶鞘颜色和颖尖颜色)变异的特性,以掌握这些农艺性状在种间和种内的变异式样。本文还对其中的部分材料进行了全基因组重测序和SNP检测,估算其核苷酸变异水平。结果表明:(1)15个农艺性状在每个物种种内有不同程度的变异,其中株高和每穗谷粒数的变异最大。(2)同一性状在不同物种间的变异较大,栽培水稻和野生祖先种相比,与产量密切相关的性状变异较大,而其它的性状则变异较小。(3)每穗谷粒数和穗长、株高、剑叶长等农艺性状显著相关。(4)野生稻中的性状变异比栽培稻更为丰富。研究结果对今后深入开展全基因组关联分析、重要新候选功能基因的挖掘以及探究决定这些性状变异的基因组学基础奠定了基础。  最后,论文还完成了与稻属系统发育关系较近的外类群Leersia perrieri的叶绿体基因组测序,注释和分析了该叶绿体基因组的结构和组成,为稻属物种的研究和利用提供了一定的依据。
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