鲤、鲫复制Sox10基因的表达和功能分化研究

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锦鲤(Cyprinus carpio var.koi)隶属鲤形目、鲤科、鲤属,为鲤的变种,是人们对自然鱼种进行杂交选育而形成的。因其姿态雍容华贵、色彩绚丽,而风靡全球。红白锦鲤作为体色鱼类的一个典型代表,具有非常重要的研究意义。本论文以红白锦鲤和红白彩鲫为研究材料,在实验室前期的研究工作基础上,对复制Sox10基因在红白体色的表达和功能分化进行研究为探明锦鲤复制Sox10基因在红白体色的表达和功能分化,采用PCR技术获得Sox10基因的全长c DNA序列分别命名为Sox10a和Sox10b。Sox10a基因c DNA总长度为3221 bp,其中5’UTR 310 bp、3’UTR 1432 bp,开放阅读框1446 bp(编码481个氨基酸)。Sox10b基因c DNA总长度为3167 bp。其中5’UTR为308 bp、3’UTR为1346 bp,开放阅读框1452 bp(编码483个氨基酸)。红白锦鲤Sox10基因的氨基酸序列与其他部分物种的相似性在43%--94%之间。RT-PCR分析显示,Sox10a、Sox10b基因在红白锦鲤皮肤、眼和脑表达量最高,鳞、鳍、鳃、肌、肠、心次之,肝和肾几乎不表达。在皮、脑、眼、鳞、鳍、鳃、肌、肠、心、肝、肾中Sox10a、Sox0b表达量依次降低,且Sox10a的表达量在各个组织中高于Sox10b。在红皮、白皮、红鳞、白鳞中,Sox10a的表达量高于Sox10b。Sox10a、Sox10b在白皮、红皮、白鳞、红鳞中的表达量分别是白皮高于红皮,白鳞高于红鳞。结果发现,锦鲤存在复制复制Sox10基因,二者序列发生变化,并且在红白体色有差异。为探明彩鲫(Carassius auratus)复制Sox10基因在红白体色的表达和功能分化,采用PCR技术获得Sox10基因的全长c DNA序列,分别命名为Sox10a和Sox10b。Sox10a基因c DNA总长度为3450 bp。其中5’UTR为282 bp和3’UTR为1728 bp,开放阅读框为1440 bp(编码480个氨基酸)。Sox10b基因c DNA总长度为3109 bp。5’UTR为295 bp和3’UTR为1365 bp,开放阅读框为1449 bp(编码483个氨基酸)。红白彩鲫的复制Sox10氨基酸序列与其他部分物种的相似性在43%--92%之间。荧光定量PCR分析显示,Sox10a、Sox10b基因在红白彩鲫脑和肌表达量最高,眼、皮、鳞、鳍、鳃、心、肠、次之,肝和肾几乎不表达。在脑、肌、眼、皮、鳞、鳍、鳃、心、肠、心、肝、肾中Sox10a、Sox0b表达量依次降低,且Sox10a的表达量在各个组织中高于Sox10b。在红皮、白皮、红鳞、白鳞中,Sox10a的表达量高于Sox10b。Sox10a、Sox10b在白皮、红皮、白鳞、红鳞中的表达量分别是白皮高于红皮,白鳞高于红鳞。结果发现,彩鲫的Sox10基因存在两份拷贝,并且在红白彩鲫的红白体色有表达和变化。
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