白菜型油菜△8-鞘脂脱氢酶基因的克隆、结构与功能的关系分析及其相关的进化研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zyq201314
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
鞘脂是真核生物细胞膜结构的重要组分,△8-不饱和鞘脂与植物的抗性生理密切相关,而△8-鞘脂脱氢酶是催化鞘脂长链基C8位脱氢生成△8-不饱和鞘脂的关键酶。目前还没有白菜型油菜△8-鞘脂脱氢酶基因的相关报道。本研究以白菜型油菜为实验材料,通过电子克隆和PCR技术,克隆得到了4个白菜型油菜△8-鞘脂脱氢酶基因,分别命名为BrD8A、BrD8B、BrD8C和BrD8D。比较基因组学和系统发生分析表明这4个基因可分为两组,第一组包括BrD8A、BrD8C和BrD8D,而BrD8B为另外一组,这两组基因在拟南芥属和芸苔属分离之前就发生了分离。这4个基因的序列同源性较高,但是RT-PCR和启动子分析表明这4个基因具有不同的表达模式:BrD8A、BrD8C和BrD8D在所检测的器官中都表达,但是在表达的具体部位上有差异;而BrD8B则可能为花粉特异性表达。将BrD8A/B/C/D与绿色荧光蛋白基因GFP融合构建融合表达载体,对其表达蛋白进行定位,发现在烟草表皮细胞中定位于内质网中。将获得的基因构建酵母表达载体转入酵母中鉴定基因的功能,确定BrD8A侣/C/D都编码有功能的△8-鞘脂脱氢酶,但具有不同的生化功能,即生成的两种产物的比例不同。与转空载的酵母细胞相比,转BrD8A/B/C/D基因的酵母细胞对铝离子的抗性有不同程度的增加。将其中的一个基因BrD8A转入拟南芥中可使其叶片长链基的8(Z)-植物鞘氨醇:8(E)-植物鞘氨醇的比例由野生型的1:3转变为1:2。以上研究结果为植物△8-鞘脂脱氢酶的生化功能多样性和进化关系提供了新的视点,并为进一步研究8(Z)-植物鞘氨醇和8(E)-植物鞘氨醇的生物合成奠定了基础。   为了进一步研究对△8-鞘脂脱氢酶活性有重要影响的氨基酸残基,我们对来自不同物种的△8-鞘脂脱氢酶和△6-脂肪酸脱氢酶进行序列对比分析。除了已知的保守的Cytb5 HPGG基序和三个组氨酸box之外,发现了15个完全保守的氨基酸残基。其中,氨基酸残基H63、N203、D208、D210和G368对酶活性是必需的,F59、W190、W345、L369和Q372对酶活性也很重要。并且,将W190、L369和Q372替换为其它的氨基酸对△8-鞘脂脱氢酶催化生成的两种产物的比例有重要影响。这些研究结果为我们提供了△8-鞘脂脱氢酶活性的分子基础,并使我们对膜结合的脱氢酶结构和功能的关系有了更深刻的了解。   最后,为了研究△8-鞘脂脱氢酶的功能和进化的关系,我们从12种植物中克隆得到20条△8-鞘脂脱氢酶基因序列。按其功能可分为两类,即倾向于生成E式产物的和倾向于生成Z式产物的△8-鞘脂脱氢酶。倾向于生成Z式产物的△8-鞘脂脱氢酶与倾向于生成E式产物的△8-鞘脂脱氢酶相比,其转化效率普遍较低。进化分析推测,在高等植物中这两类△8-鞘脂脱氢酶可能分别有着各自的祖先,但是最初都是由低等生物如酵母中只能生成E式产物的△8-鞘脂脱氢酶逐步演化而来的。这些研究结果为了解△8-鞘脂脱氢酶的功能和进化的关系提供了新的视点。  
其他文献
本文通过对荣华二采区10
期刊
蛋白质是生命活动的主要承担者,本课题着重于细菌中分子伴侣和效应物这两种蛋白质的研究。其中,分子伴侣蛋白是一类可以防止生物体内蛋白质聚集沉淀,并帮助其正确折叠的蛋白质,分
随着现代技术的发展,无线通信技术在许多领域得到了广泛的应用。与有线设备相比,它具有成本低、携带方便、无需布线的优势,特别适用于手持设备的通信、电池供电设备、遥控、遥测
综合孔径技术利用了以小口径天线阵列合成大的观测口径的技术,解决了在较低频率时天线物理口径要足够大才能得到期望的空间分辨率的严重缺陷。本文从干涉测量的原理出发,分析了综合孔径微波辐射计的基本理论。介绍了一般反演法的基本思想。阐述了包括迭代算法和维纳滤波算法在内的各种基于G矩阵的反演算法,并对在不同误差存在的情况下的算法性能进行了仿真分析。从仿真的结果可以看出,G矩阵的测量对于算法的性能有很大的影响。
无源光网络(PON)以其抗干扰能力强、可靠性高、成本低等特点,已成为各大运营商解决“最后一公里”问题的主要选择。为了提高系统的可靠性并降低网络的维护成本,经济有效地对P
深海热液与其所形成的羽流区是全球洋中脊热泉场的重要组成部分,在深海热量和物质循环中具有重要地位,并对全球海洋循环及大洋化学有着重要影响。深海热液区细菌的多样性丰富,具
人脸信息处理,主要包括人脸检测、人脸跟踪、人脸识别以及衍生出来的姿态和表情分析等几个主要领域,其中人脸检测是人脸信息处理领域中的一项关键技术。在人脸检测中,精度和
通过氮肥减量小区试验和绿肥还田下的氮肥减量小区试验,研究了太湖地区稻田田面水氮素不同形态的变化特征、氮素径流损失、渗漏损失、氨挥发损失以及氨挥发通量的动态变化特征
本文通过对荣华二采区10
期刊
Cathepsin D是一种属于天门冬氨酸肽酶家族的肽酶。已有足够的证据表明,Cathepsin D与癌症的发生和发展过程密切相关,然而,它参与这些过程的分子机制仍不清楚。本研究在Cathepsi