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目的：在中国汉族人群中开展吸烟对DNA甲基化影响的基因组关联性研究，并探讨吸烟相关CpGs的甲基化水平与吸烟内暴露标志物、相应基因表达水平之间的关联性。 方法：本研究采取两阶段（发现和验证）的研究策略，发现阶段在400名湖北招募的研究对象（包括137名焦化工人、101名急性冠脉综合征患者和162名武汉社区居民）中，进行吸烟与DNA甲基化水平的基因组关联性分析。验证阶段在196名广东招募的研究对象（包括97名急性冠脉综合征患者和99名珠海社区居民）中，对在发现阶段达到全基因组显著性水平的CpGs进行验证。所有研究对象的基因组甲基化水平均采用Illumina Human450K甲基化芯片（包含>485000个CpGs）进行检测。针对在验证阶段达到显著性水平的CpGs，进一步在48名湖北十堰招募的健康个体中探讨其DNA甲基化水平（采用Human450K甲基化芯片检测）与相应基因mRNA水平（采用Illumina HumanHT-12 v4表达谱芯片检测）之间的关联性。此外，在无多环芳烃（polycyclic aromatic hydrocarbon，PAHs）职业暴露的健康男性人群中，分析吸烟相关CpGs的甲基化水平与吸烟内暴露标志物之间的关联性。 结果：在发现阶段，有100个CpGs的甲基化水平与吸烟的关联性达到了全基因组显著性水平（FDR<0.05）。其中，34个CpGs（位于21个基因上）的甲基化水平在验证阶段与吸烟存在显著关联性（Bonferroni校正，P<5.0×10-4）。采用Meta分析的方法合并两阶段数据后，进一步发现5个CpGs（位于5个基因上）的甲基化水平与吸烟之间的关联性达到了全基因组显著性水平（P<1.16×10-7），且未被先前研究报道过，它们分别是IL6R（cg09257526），Pmeta=5.59×10-8；NPPA（cg05396397），Pmeta=1.02×10-7；CEP135（cg26542660），Pmeta=1.57×10-8；NEK6（cg14556677），Pmeta=7.99×10-9以及SALL3（cg05080154），Pmeta=4.87×10-8。在上述发现的39个CpGs中，有3个CpGs的甲基化水平与相应基因mRNA水平呈负相关关系（AHRR上的cg05575921对应mRNA探针ILMN_1782679，P=2.81×10-2；AHRR上的cg14817490对应mRNA探针ILMN_1782679，P=4.06×10-2；CDH23上的cg10750182对应mRNA探针ILMN_1779934，P=7.64×10-4）；cg26542660的甲基化水平与相应基因mRNA水平呈正相关关系（位于CEP135上，对应mRNA探针ILMN_1693766，P=1.07×10-2）。此外，在无PAHs职业暴露的健康男性人群中，通过分析吸烟相关的DNA甲基化改变与吸烟内暴露标志物（2-羟基萘）之间的关系，发现在验证阶段达到显著性水平的34个CpGs中，有16个CpGs的甲基化水平与尿2-羟基萘水平存在显著关联性（Bonferroni校正，P<1.47×10-3）。对这16个CpGs的中介效应分析结果显示，其中8个CpGs的吸烟相关甲基化改变可能由2-羟基萘介导。 结论：本研究在中国汉族人群中验证了34个与吸烟相关的DNA甲基化位点，同时发现了5个潜在的吸烟相关CpGs，其甲基化水平与吸烟的关联性未在其他研究中报道过。吸烟相关CpGs的甲基化改变可能影响相应基因mRNA的水平，且吸烟对部分基因DNA甲基化的影响在一定程度上可能由萘的代谢通路介导。