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嗜盐古菌是一类生活在高盐环境中的古细菌。细菌视紫红质蛋白（bacteriorhodopsin, BR ）是其细胞膜上的蛋白质，它具有典型的七次跨膜结构和光驱动质子泵功能，具有较高的发展前景和应用价值。本文对嗜盐古菌研究和BR 蛋白结构、功能及应用进行了概述。工作内容主要包括新疆达板城盐湖嗜盐古菌的分离和分类学研究，以及BR 核心序列的获取与分析。本研究从达板城盐湖分离了16 株嗜盐古菌，为革兰氏染色阴性的球菌和多形态菌。基于16S rDNA 序列的同源性比较及系统发育学研究表明这些菌株分属于嗜盐古菌的四个属Natrialba、Haloarcula、Haloterrigena、Halorubrum。其中所分离的嗜盐嗜碱古菌属于Natrialba 属，应为该盐湖嗜盐嗜碱古菌的优势菌群，其他菌株分属于另外三个属。
采用PCR 方法扩增到205 菌株的BR 蛋白核心序列，进行氨基酸序列比对并建立系统发育树，结果显示所研究的BR 蛋白属于DR 类型,与已报道的BR 蛋白核心序列差异明显，具有进一步研究的价值和意义。