癌症发病过程中的代谢改变，包括增强的糖酵解以及损伤的氧化磷酸化都已经被广泛报道，但是究竟这些代谢通路改变在癌症发病过程中如何起作用，与癌基因c-myc之间的相互关联，整体通路如何随时间点改变等问题目前了解得较少。在本章工作中，利用6个时间点的WHV/c-myc转基因小鼠以及正常C57BL-6小鼠模型比较，我们采用选择反应监控技术针对性地研究了59个参与糖酵解，三羧酸循环以及脂肪酸代谢过程中的蛋白质以及8个代谢过程中的重要小分子代谢中间产物。实验结果表明，3个代谢通路中很多蛋白质在特异时间点的正常组和癌症组间存在显著性差异，并且3个代谢通路整体变化趋势截然不同，糖酵解途径被显著性增强，脂肪酸代谢呈现显著性下调，而三羧酸循环则出现变化不平衡的趋势。通过相关性分析提示c-Myc蛋白能够调控包括糖酵解以及三羧酸循环在内的代谢通路，与癌症发生密切相关。进一步小分子代谢产物结果表明，小分子代谢产物的整体差异变化要早于蛋白质变化，很多代谢小分子在两个小鼠模型中都存在显著性差异。我们的数据表明转基因小鼠中谷氨酸的还原羧化代谢被显著性增强，并且这种还原羧化代谢主要依赖于Idh2以及Aco2。最后，整合蛋白质数据以及代谢小分子数据，我们发现在三羧酸循环中出现蛋白质以及代谢小分子水平的不一致，暗示了线粒体代谢在癌症中的异常以及线粒体角色的改变。