从依赖廉价劳动力、高投资、高储蓄的粗放型增长方式转变到基于创新发展的长效增长方式,是中国区域经济实现持续发展的关键所在。近年来,中国各地区创新能力不断增强,但创新仍然没有成为经济发展的主要驱动力,且各地区创新能力差异不断扩大。经济体制是创新主体最重要的生存环境之一,良好的制度环境是地区创新能力强弱的关键因素。所有制构成经济运行机制的基础,作为重要的制度因素与区域创新能力存在密切关系。本文的目的就是研究两者的关系,探究何种所有制组合将有利于地区创新能力的发展,哪种所有制形式对区域创新驱动起着更重要的作用。本文在界定“所有制结构”和“区域创新能力”的基础上,为了能全面地度量所有制结构的演变及现状,从所有制结构“量”(国有和非国有经济占比)和“质”(所有制分化指数)2个角度进行分析；并建立指标体系利用全局主成分分析法对中国区域创新能力进行了评价,从分析结果来看2001-2012年中国各地区区域创新能力整体呈上升趋势,并且具有加速增长的趋势；同时,东、东北、中、西4大地带区域创新能力差异明显,东部地区区域创新能力最高,东北、中部和西部地区创新能力较低。在此基础上,实证分析了所有制分化指数和各所有制形式对区域创新能力的影响。通过实证研究,本文得到以下结论：所有制分化指数与区域创新能力呈倒U型曲线关系,即在所有制结构的演变过程中,随着所有制结构的不断多样化,区域创新能力呈现先上升后下降的趋势；国有经济对区域创新能力影响存在差异性,在东部地区对创新能力的提高有抑制作用,而在西部地区,随着国有经济比重的提高,区域创新能力也会提升。根据研究分析结果,本文从坚持多种所有制共同发展、深化国有企业改革和进一步激发私营企业创新活力三个层面提出了促进区域创新的建议,试图达到以理论指导实践的研究目的。