虎纹蛙病毒囊膜蛋白001L、020R的筛选、鉴定及功能初步研究

来源 :中山大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiangshuhua
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
虎纹蛙病毒(Tigerfrogvirus,TFV)属于虹彩病毒科(Iridoviridae)蛙病毒属(Ranavirus),其全基因组序列在2002年完成测定。为了更好的研究病毒的结构以及病毒在感染过程、与宿主相互作用中涉及到的关键基因,我们通过蛋白质组学、基因组学和生物信息学分析的方法,筛选出了四个候选基因,ORF001L、ORF019R、ORF020R和OEF053R,作为我们的研究对象。四个基因在蛙病毒属里都比较保守,其中ORF001L和ORF020R生物信息学预测两个基因均有跨膜区,可能编码囊膜蛋白。为了鉴定这四个蛋白是否为病毒结构蛋白,我们首先将四个基因进行了克隆、原核表达。因为ORF019R表达困难,我们只对ORF001L、ORF020R、ORF053R制备了多克隆抗体。转录时相分析(transcriptional analysis)表明这三个基因均为晚期基因,与纯化病毒粒子的蛋白印迹(Western blot)显示这三个蛋白可能为结构蛋白。间接免疫荧光和感染细胞的蛋白组分检测表明ORF001L、ORF020R这两个病毒蛋白主要分布在胞质和待鉴定的膜结构上,免疫电镜的结果证实这两个蛋白均为病毒囊膜蛋白,而OR053R明确定位需要进一步鉴定。 为了进一步研究病毒蛋白的功能,我们进行了一系列的试验。抗体中和试验显示,ORF001L和ORF020R病毒蛋白的抗体都不能阻止病毒的感染,但是抗001L的抗体可以推迟上清病毒滴度高峰的出现。我们采用了RNA干扰(RNAi)技术对两个囊膜蛋白在病毒复制中的作用进行初步探讨。通过体外转录(invitrotranscription)的方法,合成了针对ORF001L和ORF020R的特异性siRNA,并通过与pEGFP-001和pEGFP-020真核质粒共转染的方法验证siRNA的特异性和有效性。把siRNA转染幼仓鼠肾(BHK)细胞,随后进行TFV感染。通过定期观察细胞病理变化(cytopathogenic effect,CPE)的方法,直接检测siRNA对病毒增殖的影响;应用半定量RT-PCR(Sq-RT-PCR)的方法进行基因表达分析,检测siRNA对基因表达水平的影响;同时应用病毒滴度(TCID50)测定的方法,检测新生的病毒量及其毒力。结果显示,这两个基因沉默以后对病毒的复制没有明显的影响,其在病毒侵染中的作用需要进一步研究。为了检测相互作用蛋白存在与否,我们使用pMAL-c2X表达载体获得了可溶性的MBP-001和MBP-020。将可溶性蛋白与细胞孵育后,再使用间接免疫荧光检测相互作用蛋白的存在。结果显示,MBP-020与源自人、鼠、鱼的细胞孵育,均能产生特异性的绿色荧光,说明了这种相互作用蛋白可能是一种普遍存在的受体。而MBP-001未见明显的绿色荧光,可能是相互作用蛋白丰度较低或蛋白活性不强。我们使用抗020R的多抗与MBP-020孵育后再感染,可以明显降低IFA,进一步说明这种相互作用蛋白的存在。
其他文献
  在新型城镇化过程当中,随着信息化发展历程的日趋加快,城乡的规划、建设、管理的服务方式急需改革,应用科学、全面、系统的理念推进新型城镇化发展已成为时代的必然性。规划
  大数据时代的到来以及"十八大"以人为本的新型城镇化战略的提出,给城市规划带来了前所未有的机遇和挑战。本文回顾了城市规划分析方法的发展历程,具体可以分为三个阶段:手工
  如何解决好城市规划与环境安全之间的协调问题是近年来城市规划研究的热点之一。本文以长沙市为例,结合2001-2010年间长沙市城市规划与环境数据,对长沙市城市规划与环境安
本论文从塑性力学中极限分析上限法入手,结合条分法的思想和大型的数学规划理论研究了在复杂条件下地基极限承载力的问题,并得到了满意的结果。证明了文中所运用的极限分析上限
  本文根据长沙历史城区街道空间结构的特点,对长沙现今的城市中心过于集聚的问题提出改善措施,并回归到历史城区的保护问题上来。指出长沙城市中心集聚发展所引起的各种问题
  规划信息化发展需求越来越大,"三分技术""七分管理""十二分数据",说明数据对规划信息化工作的重要地位。面对信息化数据管理及应用的强烈诉求,本文从规划信息化数据管理及应
  本文对中小城市地区地下工程管线档案信息化建设期间的几项重点工作的要点、作用和方向进行了分析;对动态更新管理的保障措施及运行更新模式进行了探讨。
  本文论述了城市运维实时监控中心建设的必要性和可行性,详细列举了城市运行维护实时监控的内容,探索了城市规划建设实时监控的思路,从监控内容、数据来源、关键技术等方面进
  城市地下管线是城市的重要基础设施,它的安全运行是现代化城市高效率、高质量运转的保证。聊城三维地下管线信息管理系统通过对聊城规划局相关管线数据信息,包括数字正射影
随着城市化进程的迅速发展及社会对地下管线规划管理重要性的认识,从国家到地方都逐步提高了地下管线的管理力度.本文在分析城市地下管线规划管理现状的基础上,浅谈加强城市