目前社会上存在的畜产品安全问题日益突出，为了保障广大消费者的合法权益，营造良好的消费环境，我国已将RFID技术引入了畜产品溯源系统。RFID技术凭借其诸多优势已成为畜产品溯源系统的新宠。本课题采用AVR+FAT32开发平台，基于RFID阅读器的设计方案完成了畜产品溯源系统的开发工作，为畜产品溯源提供一种可行的解决方法。该溯源系统用阅读器完成对标签的信息采集，然后通过上位机系统对标签数据进行添加、修改、删除、查询操作完成溯源。阅读器组成包括AVR128控制器模块、RMU900射频模块和TFT触摸屏模块；为了便于对射频模块进行操作和控制，实现便携式终端溯源，本文将FAT32文件系统应用到了单片机，使用TFT触摸屏实现操作控制。相对于以往的溯源系统，本课题开发的终端对FAT32文件系统的相关功能进行了应用，更方便了用户对标签数据的操作。通过对畜产品溯源系统各环节的主要信息进行记录，使用阅读器随时可以检验产品是否合格来完成溯源。通过测试，证明该溯源系统可以完成畜产品标签的跟踪溯源，能够明显提高畜产品溯源过程的工作效率，具有很好的实用价值。