【摘 要】
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本研究通过现代测序技术对人参疫病组和健康人参组进行高通量转录组测序,使用短reads组装Trinity软件做从头组装,建立人参疫病与健康人参的转录组数据库。将转录组数据序列比
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本研究通过现代测序技术对人参疫病组和健康人参组进行高通量转录组测序,使用短reads组装Trinity软件做从头组装,建立人参疫病与健康人参的转录组数据库。将转录组数据序列比对到两个Nr、Swiss-Prot蛋白质数据库、KOG、GO分析、KEGG代谢通路分析等一系列后续分析,并从基因表达结果中,筛选出人参疫病与健康人参间差异表达的基因,基于差异表达基因,进行GO功能显著性富集分析和Pathway显著性富集分析。从分子生物学角度分析人参疫病的发病机制及预防机制。为完善人参转录组数据提供信息资源,为人参疫病的预防与治疗提供研究基础,对人参抗疫病基因功能的研究做好铺垫。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,针对前期已筛选抗人参疫病基因RPS2的编码序列设计特异性较高的sg RNA,通过同源重组法将靶序列片段连接至pORECas9和pPLHACas9质粒构建CRISPR/Cas9表达载体。将质粒转化至GV3101农杆菌感受态,用于人参愈伤和叶片转化。我们共获得了 4个的突变株系,占转基因株系的1/3被编辑的结果。
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