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从GenBank查询到的蚯蚓纤溶酶（earthworm fibrinolytic enzyme，EFE）基因序列中，只有AY438624翻译的蛋白质序列与天然EfP-Ⅰ在N-端具有较高的相似性。本研究根据该基因的5’与3’序列设计引物，通过RT-PCR从赤子爱胜蚓（Eisenia fetida）获得-个完整的基因（GenBank，DQ418454）。序列分析证明，由该基因编码蛋白质的N-末端与天然EfP-Ⅰ的N-末端氨基酸顺序完全相同。ScanProsite prediction programs分析显示，该基因与AY438624相似性极高，二者均属于胰蛋白酶家族；不同的是，该基因编码的蛋白质序列中含有N-糖苷键的结构域，所以DQ418454是EfP-Ⅰ中的一个新基因。在此基础上，我们构建了该基因的原核表达载体pMAL-c2X-EfP-Ⅰ，并进行了转化、诱导和表达。Western blotting证明，表达产物同时具有MBP和EfP-Ⅰ的抗原特异性，是MBP和EfP-Ⅰ的融合蛋白（MBP-EfP-Ⅰ）。经亲和层析分离纯化的MBP-EfP-Ⅰ，在酪蛋白平板和纤维蛋白平板上表现出明显的纤溶酶活性。另外本研究还构建了非融合表达载体pBV221-EfP-Ⅰ，经诱导，非融合产物EfP-Ⅰ以包含体的形式得到表达，需要进一步的复性研究。相比之下，融合表达具有一定的优势，但该产物与天然蛋白在体内外是否具有相同的药理、药效作用，有待深入研究。
抗菌肽（Antimicrobial Peptides，AMPs）是生物体内组成性或诱导性表达的一些具有抗菌活性的小分子内源肽，它们构成了机体防御病原体的快速而高效的天然免疫系统。蚯蚓经过几亿年的进化，逐渐形成了抵御外来微生物侵袭的机制，可以产生一些抗菌肽成分。本研究参考GenBank中登录的蚯蚓抗菌肽PP-1的mRNA序列（GenBank，AY167143）设计特异引物，通过RT-PCR.从蚯蚓（Pheretima tschiliensis）中获得了与Pp-1 CDS相似性极高、3’非编码区差异较大的DNA新序列（GenBank，DQDQ436458）。
在此基础上，分别构建了该基因的融合表达载体pMAL-p2X-EAp-1和非融合表达载体pKW32-EAp-1，并进行了转化、诱导和表达。蛋白质电泳证明，两种表达载体均有表达产物，并且获得的融合表达产物MBP-EAP-1和非融合表达产物EAP-1的大小与预测相同。利用亲和层析分离纯化了MBP-EAP-1，但是没能检测到抗菌活性。
根据与EAP-1蛋白质序列相似性极高的LumbricinⅠ（6-34）的序列，人工合成了该29肽。实验表明，LumbricinⅠ（6-34）29肽具有广谱抗菌活性。根据大肠杆菌密码子的偏爱性，设计合成了该29肽单链编码DNA，通过PCR获得双链DNA基因，并成功得到pMD19-T-29aa克隆载体。测序证明克隆的序列与原设计一致。这些工作为以后的克隆表达打下了基础。