该论文采用本实验室建立的一种新的实验RNA组学方法—锚定引物法,以水稻幼芽为研究材料,分别运用oligodT引物和特异引物CDdT16与ACAdT16构建了3个不同的cDNA文库.测序分析表明,采用特异引物构建文库可以使某一类snoRNA相对富集;文库中含有高丰度的rRNA克隆,需采用有效的筛选技术,才能提高测序效率.在该实验室创建的PCR产物点阵膜杂交筛选技术的基础上,对其在植物cDNA文库筛选中的应用条件进行了优化,筛选后测序结果表明,snoRNA以及ncRNA候选序列的测出比例大大提高,而rRNA的测出比例明显降低,说明该论文中采用的杂交筛选技术可有效筛出文库中的重复克隆,使测序效率得到明显改善.结果表明,运用锚定引物法构建cDNA文库以及PCR点阵膜杂交筛选技术可有效分离和鉴定snoRNA新基因,该研究鉴定了大批水稻snoRNA的新种类,同时也获得大量ncRNA候选序列,为植物ncRNA的深入研究奠定了基础.对两大类snoRNA的结构与功能分析表明,大多数snoRNA具有指导rRNA转录后修饰的功能,少数snoRNA可指导snRNA的转录后修饰,另有部分snoRNA是目前功能未知的新种类,说明植物snoRNA的种类及功能远比想象的复杂,其结构与功能的研究,对最终阐明snoRNA在生物新陈代谢中的调控作用以及揭示snoRNA基因的起源与进化具有重要意义.对鉴定自水稻的29种新的box C/D snoRNA和26种新的box H/ACA snoRNA进行基因组织分析表明,大部分snoRNA在水稻基因组中成簇分布;同时,发现了两种新的snoRNA基因组织形式即纯box H/ACA snoRNA基因簇,以及tRNA-snoRNA双顺反子基因簇.这些结果极大丰富了snoRNA基因组织的多样性,为深入了解真核生物snoRNA基因结构,基因组织和表达机制开辟了新的道路.