在我国的种植业生产中,为了提高作物的产量,自80年代以来无机化肥的施用量逐年大幅上升,并且普遍采用连作耕种,导致近年来出现肥料边际效应明显下降、有时非但不能提高其产量,而且还造成了土壤理化性质恶化、土传病害严重、环境严重污染等问题,使得连作土壤中的作物容易出现生长不良、大面积感病等连作障碍现象。为了改善大量施用化肥对土壤理化和微生态的破坏,缓解连作障碍,新型配方有机肥备受关注。在本研究中,将泥炭、蚕沙以及发酵废液(酵母、味精)复配,得到五种不同的基质配方有机肥,将这些基质配方肥基施于连作土壤培养的辣椒中,比较它们对土壤理化性质和微生态结构、辣椒的产量与品质的影响。研究结果显示：多种配方有机肥对提高作物根际土壤微生物多样性和提高作物品质有明显作用。其中蚕沙与酵母发酵废液的复配物效果最为显著,使辣椒的抗病率提高了27.5%,提高了辣椒的辣椒素和维生素C的含量,增加了土壤微生态结构的多样性。从连作土壤中分离到了两株辣椒猝倒病的病原菌(茄病镰刀菌,Fusarium solani),分别命名为FS.X和FS.C；以此病原菌为靶标,从施用有机肥的土壤中筛选拮抗细菌,得到了十株拮抗菌,其中抗菌效果最强、最广谱的是一株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtil is BZL8)。研究发现,其拮抗物质包括一些挥发性物质、蛋白类物质以及脂肽类物质,且脂肽类物质的抑菌效果要强于蛋白类物质。为提高脂肽类物质的表达,进行了发酵培养基组分的优化,经过初步优化,得到培养基配方5(玉米粉：20g/L；黄豆粉：20g/L；胰蛋白胨16g/L以及NaC1:2g/L),与出发培养基NB相比,在更为经济的培养基的基础上得到了相等水平的脂肽的表达量。