【摘 要】
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目的:
比较碰撞诱导解离(collision induced dissociation,CID)和高能碰撞解离(high energy collision dissociation,HCD)两种离子裂解方式在蛋白质组学分析方面的差异。
方法:
以牛血清白蛋白和细胞裂解物为研究对象,分别应用碰撞诱导解离(CID)和高能碰撞解离(HCD)两种离子裂解方式对样品进行分析,比较所鉴定到的多肽和蛋白数目,确定两种离子裂解方式在蛋白质组学分析方面的差异。
结果:
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目的:
比较碰撞诱导解离(collision induced dissociation,CID)和高能碰撞解离(high energy collision dissociation,HCD)两种离子裂解方式在蛋白质组学分析方面的差异。
方法:
以牛血清白蛋白和细胞裂解物为研究对象,分别应用碰撞诱导解离(CID)和高能碰撞解离(HCD)两种离子裂解方式对样品进行分析,比较所鉴定到的多肽和蛋白数目,确定两种离子裂解方式在蛋白质组学分析方面的差异。
结果:
在简单样品牛血清白蛋白中,HCD碎裂方式所得的谱图匹配率和多肽Mascot得分较高,表明其质谱图质量较高。在复杂样品细胞裂解物中,CID碎裂方式鉴定到的谱图数、多肽数和蛋白数目较多,表明该方式灵敏度较高;HCD碎裂方式所得质谱图匹配率较高、Mascot得分较高,表明其质谱图质量较好。
结论:
这两种方式均可用于大规模蛋白质组学分析,CID方式可以提供更高的灵敏度,HCD方式可以获得更高质量的质谱谱图。
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