临床实践指南（Clinical practice guidelines,CPGs,也称临床指南）针对各种特定的医疗问题,通过系统科学的方法为医生提供专业可信的推荐意见与诊疗措施,是指导医疗研究和实践的最佳依据。构建计算机可执行的临床指南能够辅助医疗决策,是目前促进指南应用,提高医疗质量的重要手段。制定计算机可执行的临床指南需要基于文本型指南设计知识组织和表示方法,并将文本形式的指南转化为知识表示形式。当前高效的自动化制定过程面临着极大的挑战:缺乏既符合文本型指南编写习惯又符合计算机可执行要求的指南制定与行文规范,难以形成有效的知识组织与表示结构,不利于从文本型指南自动转化为计算机可执行的指南。针对这些挑战,本文着重研究指南制定过程中的知识组织和表示方法,并探索将典型的文本型指南中的诊断标准自动转化为计算机可执行的指南中相应内容的技术。本文的主要工作如下:（1）制定了一种临床指南知识的组织和表示方法。以指南的制定流程规范为基础,在指南类别、指南内容、指南中的诊断标准和治疗推荐这三个层次上,分别从分类和汇集、指南内容分类体系和组织形式、表示规则和表述规范等角度,形成了以基于层级结构的指南编目和规则为核心的指南知识的组织和表示方法。（2）设计了一种针对诊断标准的半自动编目方法。基于诊断标准编目方法与规则,以头痛类疾病的临床指南为例,对其中诊断标准部分的知识类型与描述方式进行了深入分析,采用基于词典、模板与机器学习的方法抽取包括医学实体与关系的诊断知识,设计并实现了半自动编目的方法,以头痛病“频发性紧张型头痛”为例验证了方法的可行性。（3）设计并实现了一个临床指南辅助制定原型系统。依据采用层级结构的指南编目规则和方法,设计并实现了计算机可执行的指南的存储、展示以及文本型诊断标准的半自动编目,为基于临床指南的进一步的探索提供基础。本文的主要成果有:（1）提出了一种基于层次结构的临床指南编目方法,包括指南类别编目、指南内容编目以及诊断标准与治疗推荐编目。（2）提出了一种基于层次编目结构的诊断标准文本半自动化编目方法。