在城市化过程中,城市系统不断完成着从无序到有序或从一种有序到另一种有序的演化,在演化过程的各个节点都有可能发生突变,当这种突变不适应城市的正常发展时,就会演化为对城市发展和人类健康造成负面影响的“城市病”。而随着目前中国城市化率超过50%,即将进入“城市病”的爆发期,在这一环境下,健康城市成为治理“城市病”的一个好选择。从健康城市角度研究城市社会、经济、环境之间相互作用有机结合的机制,进而引导城市系统良好运行以满足人的健康和福祉需求显得尤为重要。首先,本文对耦合与协调的概念进行界定,结合目前学术界对健康城市系统社会、经济、环境三者关系的研究,对健康城市复合系统耦合协调内涵、交互耦合机制及耦合过程进行阐述。在此基础上,构建健康城市系统耦合度和协调度评价模型,并利用该模型对重庆市健康城市系统耦合协调状况进行评价。当前,重庆市处于磨合耦合阶段,环境与经济的耦合关系对重庆市健康城市系统耦合度起到重要的影响作用,尤其是经济效率与环境质量的相互作用;同时这一时期社会与环境是城市发展的重心,公平保障、公共服务与环境管理是提升重庆市健康城市系统耦合度的关键方向。同时重庆市健康城市系统整体处于极限发展阶段,其矛盾点主要为社会与环境的不协调,对于提升重庆市健康城市系统协调度起到决定性作用的是公平保障、公共服务与环境质量、环境管理之间的协调关系。同时本文分析了系统层、准则层、指标层之间的耦合协调关系,针对可有效提高重庆市健康城市系统耦合协调水平的几个要素,提出了引导重庆市健康城市系统良好运行的对策与建议。