知识经济时代，科技创新已成为推动经济、社会发展的重要驱动因素之一。而科技创新过程是一个复杂的社会性系统工程，需要政府、科研单位、企业等各类组织的协同作用。北京市为推动中小科技企业创新发展，推出了统筹资金股权投资新模式，全力支持企业的创新发展，这种新的政府资金支持模式，对风险企业的内部治理机制产生了相应的影响。　　 论文首先在分析了统筹资金股权投资的内涵的基础上，明确了统筹资金股权投资的含义和意义，界定了统筹资金股权投资相关管理机构的职责、股权投资操作的流程和范围。从统筹资金股权投资各个环节的关系出发，讨论了主管单位与股权代持机构之间的责权约定，以及股权代持机构与风险企业之间的责权约定，详细阐述了主管单位一股权代持机构一风险企业这三个关键因素之间的权力委托和责任划分过程，重点提炼了涉及影响风险企业内部治理机制的有关责权约定内容。随后，系统的总结了统筹资金股权投资管理模式的特点。　　 在分析了统筹资金股权投资的特点和基本状况后，本文运用定性和定量的研究方法，系统分析了统筹资金股权投资对风险企业内部治理机制的影响，重点风险企业股权结构、董事会制度、经理层激励约束机制等三方面的影响进行了分析和论证。在此基础上，利用案例分析，实证研究了统筹资金股权投资对风险企业股权结构、董事会制度、经理层激励约束机制等方面的影响。　　 最后，根据对统筹资金股权投资风险企业内部治理机制影响的风险因素分析，论文从促进风险企业内部治理机制规范、实现创新发展的角度出发，从完善大小股东之间的利益制衡机制、监事聘任、股权激励制度、股权结构、运营制度五个方面提出了相关建议。